Preparación de bibliotecas NGS

Kits de extracción de ADN genómico

Para la preparación de bibliotecas de ADN, ADN genómico de alto peso molecular (ADNg) debe extraerse de células, tejidos u otros tipos de muestras. El ADN genómico purificado debe tener un cizallamiento y unos contaminantes biológicos y químicos mínimos para un rendimiento óptimo en las reacciones de amplificación o secuenciación posteriores.

El Fire Monkey™/Fire Flower™ kit de extracción de ADN de alto peso molecular permite aislar ADN genómico de alta pureza con un cizallamiento mínimo y contaminantes de ácido nucleico de bajo peso molecular.

• Fire Monkey™ es un proceso estándar de columna centrífuga que extrae ADN de alto peso molecular con longitudes de cadena medias de >100kb a partir de células bacterianas o células de mamífero en 1 hora.
• Fire Flower™ es un proceso estándar de columna centrífuga que puede seleccionar el tamaño del ADN extraído de cualquier fuente de muestra en 15 minutos. Fire Flower™ puede aumentar la longitud media total de la cadena en un 30% al tiempo que elimina fragmentos de ADN de hasta 30kb. 

Kits de amplificación de genoma completo

El análisis de secuencias de ADN a menudo se ve limitado por las pequeñas cantidades de muestra disponible o el bajo rendimiento de la extracción. Cuando el material de partida es limitado, se pueden utilizar técnicas de amplificación para aumentar la cantidad de ADN de partida. La amplificación del genoma completo (WGA) puede utilizarse para preamplificar muestras de ADN tanto intactas como muy fragmentadas para su introducción en flujos de trabajo de NGS.

El kit SeqPlex-I WGA permite la amplificación de pequeñas cantidades de ADN degradado o altamente fragmentado para su introducción directa en las celdas de flujo de secuenciación de próxima generación (NGS) de Illumina®.

• Facilita la secuenciación a partir de tan solo 100 pg de ADN
• Cebadores mejorados para una cobertura completa del genoma, un sesgo de secuencia mínimo y un tamaño de amplicón ideal para la secuenciación de próxima generación (NGS)
• Coste-efectivo: Sin paso adicional de preparación de bibliotecas NGS
• Compatible con la secuenciación de próxima generación Illumina®

El SeqPlex Enhanced DNA Amplification Kit para la amplificación del genoma completo está diseñado para facilitar la secuenciación de próxima generación a partir de cantidades extremadamente pequeñas o de ADN degradado/altamente fragmentado. Este kit ha sido desarrollado para integrarse en los flujos de trabajo de secuenciación Illumina^®, SOLiD™, o 454.

• La tecnología de cebado aleatorio amplifica el ADN fragmentado como ChIP o FFPE
• Facilita la secuenciación a partir de tan sólo 100 pg .nbsp;de ChIP ADN
• Cartillas mejoradas para una cobertura completa del genoma, mínimo sesgo de secuencia, y eliminación de cartillas
• Compatible con Illumina^®SOLiD™, o 454 library prep para secuenciación de nueva generación

Kits de amplificación de transcriptoma completo

El principal objetivo en la preparación de una biblioteca de NGS para RNA-Seq es maximizar la complejidad de la biblioteca de transcriptomas para representar completamente el conjunto inicial de secuencias y reducir el sesgo.RNA-Seq para el perfilado de la expresión génica de alto rendimiento y el análisis del transcriptoma suele verse dificultado por las bajas cantidades de ARN de partida. La amplificación del transcriptoma completo (WTA) se puede utilizar para generar cantidades suficientes de objetivos de secuenciación a partir de pequeñas cantidades de ARN, pero requiere una alta fidelidad de secuenciación;requiere una replicación de transcripción de alta fidelidad sin pérdida o distorsión de ARNm específicos para reducir el sesgo de la biblioteca.

El kit SeqPlex-I WTA permite la amplificación de pequeñas cantidades de ARN transcrito inversamente o ARN degradado para su introducción directa en celdas de flujo de secuenciación de próxima generación (NGS) Illumina®.

• Amplifica cantidades fragmentadas o extremadamente pequeñas de ARN total.
• El ARN fragmentado o intacto de todas las fuentes, incluyendo FFPE y RIP, se amplifica fácilmente utilizando la tecnología de cebado aleatorio.
• El diseño semidegenerado del cebador de la biblioteca garantiza una cobertura más completa del transcriptoma y un cebado eficiente
• Menos pasos: No es necesario fragmentar el ADNc antes de la secuenciación
• Alta eficiencia: Amplifica el ds-ADNc en 8 horas o menos
• Coste-efectivo: Ya no requiere un paso adicional de preparación de bibliotecas NGS
• Compatible con la secuenciación de próxima generación Illumina^®

El SeqPlex RNA Amplification Kit para la amplificación del transcriptoma completo (WTA) está diseñado para facilitar la secuenciación de próxima generación (NGS) a partir de pequeñas cantidades o de ARN degradado/altamente fragmentado (e.Por ejemplo, ARN de muestras de tejido fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE). El kit SeqPlex permite al usuario preamplificar muestras de ARN para introducirlas en un flujo de trabajo de NGS.

• La tecnología de cebado aleatorio amplifica bajas cantidades de ARN fragmentado o intacto de todas las fuentes, incluidas FFPE y RIP.
• Diseño de cebadores de bibliotecas semidegeneradas para una cobertura más completa del transcriptoma y un cebado eficiente.
• No es necesario fragmentar el ADN antes de la secuenciación.
• Amplifica ds-ADN en 8 horas o menos.
• Compatible con todas las plataformas de secuenciación de nueva generación excepto Pacific Bioscience.