Prestige Antibodies®: El Atlas Celular
En 2015, el proyecto «Human Protein Atlas» presentó un mapa completo de la expresión del proteoma humano en los tejidos humanos. El «Tissue Atlas» y el «Cancer Atlas» incluyen datos de 17 500 anticuerpos Prestige Antibodies®.
La última incorporación al Atlas de Proteínas Humanas es el Atlas Celular, una herramienta fantástica para cualquiera que trabaje con anticuerpos para ICC-IF o en biología celular en general. El Atlas Celular presenta datos de más de 10 000 anticuerpos Prestige Antibodies®.
Los procesos biológicos que tienen lugar en el interior de la célula son fundamentales para toda forma de vida. Una clave para comprender mejor los mecanismos de las células vivas es determinar la localización subcelular de las proteínas activas en ellas. Los distintos orgánulos ofrecen un entorno con diferentes condiciones fisiológicas, componentes y socios de interacción, lo que determina la función de las proteínas.
La sección «Cell Atlas» del Atlas de Proteínas Humanas (Human Protein Atlas) muestra la distribución espacial de las proteínas en la célula humana. Para cada proteína se dispone de tinciones inmunofluorescentes realizadas con anticuerpos específicos contra el objetivo en varias líneas celulares humanas, localizaciones subcelulares anotadas y la expresión del ARN del gen diana en un gran número de líneas celulares. Para muchas de las proteínas, también se incluyen los resultados de diferentes ensayos de validación realizados, tales como la silenciación mediante siRNA, la colocalización con GFP y los análisis de dependencia del ciclo celular.
Captura de pantalla del Atlas de Proteínas Humanas en la que se muestra parte de la información sobre la ciclina B1 en el Atlas Celular. La ciclina B1 se localiza en el citosol de la célula.
El Cell Atlas se divide en cuatro capítulos distintos, que ofrecen un análisis basado en el conocimiento de los proteomas celulares humanos:
- Transcriptoma de líneas celulares
- Proteoma de los orgánulos
- Proteoma
multilocalizado - Proteoma dependiente del ciclo celular
Los distintos capítulos incluyen descripciones y análisis de los patrones de expresión de las proteínas, una lista completa de las proteínas expresadas en el proteoma, así como ejemplos de imágenes detalladas que ilustran los patrones de distribución espacial subcelular.
Imagen cortesía del Atlas de Proteínas Humanas
Para el Atlas Celular, se ha utilizado la microscopía confocal con el fin de obtener imágenes de alta resolución y en cuatro colores en líneas celulares. En las imágenes multicolores se muestran tres marcadores de orgánulos diferentes junto con el anticuerpo específico como canales distintos:
- Anticuerpo teñido en verde
- Núcleo teñido en azul
- Microtúbulos en rojo
- RE en amarillo
Mediante el botón «alternar canales» de las imágenes de alta resolución, se pueden activar y desactivar los distintos canales.
Inmunofluorescencia de la línea celular U-2 OS. Anticuerpo HPA030741 (anti-CCNB1) en verde, núcleo teñido en azul y microtúbulos en rojo. En la imagen de la derecha, solo está activado el canal verde, que muestra la tinción del anticuerpo.
Las imágenes del Cell Atlas ofrecen una resolución a nivel de célula individual, lo que permite estudiar las variaciones en los patrones de expresión proteica de una célula a otra. Las células se cultivan en condiciones asincrónicas, por lo que la explicación más probable de las variaciones entre células individuales es un efecto del ciclo celular.
El anticuerpo anti-MRPS7, HPA022522 (teñido en verde) muestra variaciones a nivel de célula individual en la línea celular A-431
A continuación se muestran ejemplos de anticuerpos de Prestige Antibodies® que destacan tres orgánulos diferentes.
El anticuerpo anti-DDX39B (HPA058450) detecta la proteína DDX39B, una helicasa de ARN del espliceosoma, que interviene en la exportación nuclear del ARNm empalmado y no empalmado. En la línea celular humana MCF7, la tinción inmunofluorescente con el anticuerpo HPA058450 muestra su localización en las motas nucleares (tinción del anticuerpo en verde).
El anticuerpo anti-COPG1 (HPA037866) está dirigido contra la proteína subunidad gamma-1 del complejo coatómero, que interviene en la mediación del transporte de proteínas desde el retículo endoplásmico, pasando por el aparato de Golgi, hasta la red trans-Golgi. El anticuerpo HPA037866 se localiza en el aparato de Golgi mediante tinción inmunofluorescente de la línea celular humana U-2 OS (tinción del anticuerpo en verde).
El anticuerpo anti-KIF5B (HPA037589) detecta la proteína de cadena pesada de la kinesina-1, un motor dependiente de los microtúbulos necesario para la distribución normal de las mitocondrias y los lisosomas. Mediante inmunofluorescencia en la línea celular humana U-2 OS, el anticuerpo HPA037589 muestra una localización en el citosol y en el centro organizador de microtúbulos (tinción del anticuerpo en verde).
Todos los anticuerpos desarrollados para el Atlas de Proteínas Humanas —que comprende el Atlas Celular, el Atlas de Tejidos y el Atlas del Cáncer— están disponibles a través de nosotros bajo la marca Prestige Antibodies®.