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この商品について
実験式(ヒル表記法):
C21H20BrN3
CAS番号:
分子量:
394.31
UNSPSC Code:
41105322
NACRES:
NA.31
PubChem Substance ID:
MDL number:
Beilstein/REAXYS Number:
3642536
grade
Molecular Biology
Quality Level
product line
BioReagent
concentration
500 μg/mL in H2O
technique(s)
electrophoresis: suitable
suitability
suitable for gel electrophoresis
SMILES string
[Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
InChI
1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
InChI key
ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N
Application
臭化エチジウム(EtBr)は、PAGEまたはアガロースゲル電気泳動で核酸の染色に最も一般的に使用されています。EtBrの蛍光は、二本鎖RNAに結合すると21倍に、二本鎖DNAに結合すると25倍に増加するため、低濃度(10 μg/mL)で染色する場合はバックグラウンドを脱色する必要がありません。臭化エチジウムは、核酸に対する蛍光分析で多数使用されています。一本鎖DNAと(強力ではないが)結合し、また三本鎖DNAと結合することが示されています。DNAに結合する能力があることから、EtBrはDNAポリメラーゼの阻害剤です。
オートファジー(自己貪食)におけるミトコンドリア損傷シグナルを調べることを目的として、mtDNAを枯渇させるために臭化エチジウム溶液が使用されています。また、これはコメットアッセイを用いてDNA損傷を検出するためにも使用されています。
Biochem/physiol Actions
臭化エチジウムは二本鎖のDNAとRNAとにインターカレーションし、フレームシフト型変異原物質として作用します。生存細胞、アポトーシス細胞、および壊死細胞を区別するため、アクリジンオレンジと併用することもできます。
Preparation Note
電気泳動後のゲルの染色に用いる場合は、ストック溶液を水で0.5 μg/mlに希釈して、15~30分間ゲルを浸漬します。通常、脱色の必要はありませんが、バックグラウンドを下げる必要がある場合は水に15分間浸漬します。染色後、UVライトボックス(波長254 nm)上でDNAのバンドを検出します。ゲルおよび泳動用バッファーに臭化エチジウムを0.5 μg/mlとなるよう添加しておくと、泳動終了後すぐにバンド検出を行なうことができます。
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保管分類
12 - Non Combustible Liquids
wgk
nwg
flash_point_f
Not applicable
flash_point_c
Not applicable
関連コンテンツ
Ethidium bromide is a well-known and widely used fluorescent dye in biotechnology research.
Product Information Sheet
Autophagy-deficient Kupffer cells promote tumorigenesis by enhancing mtROS-NF-kappaB-IL1alphabeta-dependent inflammation and fibrosis during the preneoplastic stage of hepatocarcinogenesis
Sun K, et al.
Cancer letters, 388, 198-207 (2017)
Hydrogen peroxide-induced oxidative damage in peripheral blood lymphocytes from rats chronically treated with corticosterone: The protective effect of oxytocin treatment.
Stanic D
Chemico-Biological Interactions, 256, 134-141 (2016)
Ulrich Braunschweig et al.
Genome research, 24(11), 1774-1786 (2014-09-27)
Alternative splicing (AS) of precursor RNAs is responsible for greatly expanding the regulatory and functional capacity of eukaryotic genomes. Of the different classes of AS, intron retention (IR) is the least well understood. In plants and unicellular eukaryotes, IR is