表观遗传学

DNA甲基化

DNA甲基化是表观遗传学中最广为人知的机制。该过程通常涉及一种甲基转移酶，该酶协助在胞嘧啶（C）的第五位（C5）上添加一个甲基。这种甲基化主要发生在胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤（CpG）二核苷酸上。不过，非CpG甲基化也会发生。 通常会进行DNA甲基化分析以帮助理解基因表达。此类分析的示例包括：通过DNA消化进行甲基化定量，随后采用高效液相色谱（HPLC）或质谱（MS）进行分析；或者采用亚硫酸氢钠转化法，随后进行PCR测序和分析。

组蛋白修饰

组蛋白修饰是另一种经典的表观遗传机制。它涉及通过乙酰化、甲基化、磷酸化以及其他影响基因表达的机制，以多种方式改变组蛋白。 组蛋白是一种蛋白质，它与DNA共同构成核小体。核小体的聚合形成了染色质，而染色质则构成了染色体。通常，组蛋白修饰发生在组蛋白N端尾部，该区域含有高比例的赖氨酸或精氨酸氨基酸。研究这种表观遗传调控的一种方法是使用染色质免疫沉淀（ChIP）实验。

RNA调控

与其他表观遗传机制相比，人们对RNA调控的了解尚不充分。目前认为，RNA信号传导通过调节染色质结构在表观遗传学中发挥作用。 研究人员正在探索mRNA，特别是长非编码RNA和微RNA等非编码RNA，是如何调控基因表达的。此外，还可以利用RNA纯化法分离染色质（ChIRP）或RNA免疫沉淀（RIP）实验，来理解染色质与RNA之间的关系，以及RNA在表观遗传学中的作用。