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Merck

D9542

DAPI

for nucleic acid staining

Synonyme(s) :

4′,6-Diamidino-2-phénylindole dihydrochloride, 2-(4-Amidinophényl)-6-indolecarbamidine dihydrochloride, DAPI dihydrochloride

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About This Item

Formule empirique (notation de Hill) :
C16H15N5 · 2HCl
Numéro CAS:
28718-90-3
Poids moléculaire :
350.25
UNSPSC Code:
12352200
NACRES:
NA.52
PubChem Substance ID:
24894305
EC Number:
249-186-7
Beilstein/REAXYS Number:
4894417
MDL number:
MFCD00012681

Nom du produit

DAPI, for nucleic acid staining

InChI key

FPNZBYLXNYPRLR-UHFFFAOYSA-N

InChI

1S/C16H15N5.2ClH/c17-15(18)10-3-1-9(2-4-10)13-7-11-5-6-12(16(19)20)8-14(11)21-13;;/h1-8,21H,(H3,17,18)(H3,19,20);2*1H

SMILES string

Cl.Cl.NC(=N)c1ccc(cc1)-c2cc3ccc(cc3[nH]2)C(N)=N

grade

Molecular Biology

assay

≥98% (HPLC)

form

powder

technique(s)

transfection: suitable

solubility

H2O: 20 mg/mL
PBS: insoluble

ε (extinction coefficient)

30 at 263 nm in H2O at 1 mM

fluorescence

λex 340 nm; λem 488 nm (nur DAPI)
λex 364 nm; λem 454 nm (DAPI-DNA-Komplex)

suitability

suitable for fluorescence

storage temp.

2-8°C

Quality Level

300

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Application

Adapté aux applications suivantes :
  • Coloration de l′ADN dans des gels d′agarose
  • Analyse des modifications de l′ADN lors de l′apoptose
  • Détection des mycoplasmes
  • Photofootprinting de l′ADN
  • Coloration par immunofluorescence des cellules

Le DAPI a été utilisé :
  • pour la surveillance rapide de la contamination microbiologique
  • dans la technique de coloration des bandes de chromosomes
  • pour la détection des cellules apoptotiques
  • en microscopie à fluorescence, pour suivre le mouvement de la protéine DisA (DNA integrity scanning protein) sur l′ADN de Bacillus subtilis
  • pour colorer les grains de pollen matures (0,5 mg/ml)
Le DAPI est nettement plus sensible que le bromure d′éthidium pour marquer l′ADN dans les gels d′agarose.
Le DAPI est nettement plus sensible que le bromure d′éthidium pour marquer l′ADN dans les gels d′agarose. Il peut être utilisé dans le photofootprinting de l′ADN, pour détecter les sondes hybridées dans les applications sur membranes en permettant la visualisation spécifique des complexes double-brins, et pour évaluer les changements de l′ADN et de son contenu lors de l′apoptose par cytométrie en flux. La coloration par DAPI est également une méthode sensible et spécifique de détection des mycoplasmes.

Biochem/physiol Actions

Sonde fluorescente pour l′ADN qui se lie dans le petit sillon, capable de pénétrer dans les cellules. Se lie au petit sillon d′ADN double brin (préférentiellement à l′ADN riche en AT), formant un complexe stable dont l′intensité de fluorescence est environ 20 fois plus élevée que celle du DAPI non lié.

Disclaimer

Protéger de la lumière.

General description

Le DAPI (dichlorhydrate de 4′,6-Diamidino-2-phénylindole) est un colorant fluorescent capable de pénétrer dans les cellules et de se lier à l′ADN.
la chaleur ou la sonication peuvent être nécessaires. Les solutions stockées à l'abri de la lumière à température ambiante ou à 4 °C devraient être stables pendant 2 à 3 semaines.

Other Notes

Lauréat du prix CiteAb 2024 récompensant les avancées des fournisseurs dans la recherche sur la maladie de Parkinson

pictograms

Exclamation mark
GHS07

signalword

Warning

Hazard Classifications

Skin Irrit. 2 - Skin Sens. 1A - STOT SE 3

target_organs

Respiratory system

Classe de stockage

11 - Combustible Solids

wgk

WGK 3

flash_point_f

Not applicable

flash_point_c

Not applicable

ppe

Eyeshields, Gloves, type N95 (US)

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Certificats d'analyse (COA)

Lot/Batch Number
0000502555
0000502555
0000496874
0000496874
0000486019

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  1. Which document(s) contains shelf-life or expiration date information for a given product?

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  2. How do I get lot-specific information or a Certificate of Analysis?

    The lot specific COA document can be found by entering the lot number above under the "Documents" section.

  3. How should D9542, 4´,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride (DAPI), be dissolved?

    This product is soluble in water at 20 mg/mL, but may require heat.  DAPI does not dissolve readily in PBS, 0.1 M phosphate, or 0.1 M Tris (pH 7).

  4. How should D9542, 4´,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride (DAPI), be stored once in solution, and for how long would it be good?

    Solutions stored in the dark at room temperature have been stable for 2-3 weeks, but solutions exposed to light for the same time period have shown considerable degradation.  At 1 mg/mL, solutions are stable in the dark at 2-8 °C for several weeks.  For long-term storage, the solutions can be divided into aliquots and stored at -20 °C.

  5. Aside from the applications described on the product page, how is D9542, 4´,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride (DAPI), used?

    DAPI is used as a nuclear counterstain in our FISH protocol at 2 μg/mL in antifade mounting media. DAPI can also be used as a vital dye to stain mature pollen grains (0.5 μg/mL). DAPI can bind to RNA, but its selectivity for DNA over RNA is high.  It appears that DAPI uses an intercalating binding mode with RNA that is AU selective (Biochem., 31, 3103 (1992)). Selectivity of DAPI for DNA over RNA is greater than that shown by ethidium bromide and propidium iodide (Nucleic Acid Research, 6, 3535 (1979))

  6. How do I find price and availability?

    There are several ways to find pricing and availability for our products. Once you log onto our website, you will find the price and availability displayed on the product detail page. You can contact any of our Customer Sales and Service offices to receive a quote.  USA customers:  1-800-325-3010 or view local office numbers.

  7. What is the Department of Transportation shipping information for this product?

    Transportation information can be found in Section 14 of the product's (M)SDS.To access the shipping information for this material, use the link on the product detail page for the product. 

  8. What is the stability of  D9542, 4´,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride?

    Product D9542, 4´,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride has a stability of 3 years as supplied. The product in solution is also stable in the dark at 4°C and showed no signs of degradation after three weeks at room temperature in the dark.  Material exposed to light showed significant degradation. We have developed an HPLC method for our DAPI products that shows reassay results from July 2012 for lots that were originally released for sale in December 2008, for both D9542 (DAPI dihydrochloride) and D9564 (DAPI dilactate).

  9. My question is not addressed here, how can I contact Technical Service for assistance?

    Ask a Scientist here.

Yan Li et al.
Toxicology letters, 154(3), 225-233 (2004-10-27)
Excessive exposure to synthetic and endogenous estrogens has been associated with the development of cancer in several tissues including the breast. 4-Hydroxyequilenin (4-OHEN), a major catechol metabolite of equine estrogens present in Premarin, an estrogen replacement formulation, has been shown
Michal Bejerano-Sagie et al.
Cell, 125(4), 679-690 (2006-05-23)
In response to DNA damage, cells activate checkpoint signaling cascades to control cell-cycle progression and elicit DNA repair in order to maintain genomic integrity. The sensing and repair of lesions is critical for Bacillus subtilis cells entering the developmental process
S Ituarte et al.
Genetica, 122(2), 199-206 (2004-12-22)
Male karyotype and meiosis of Tenagobia fuscata (Corixoidea, Micronectidae) are studied. The species possesses a male diploid chromosome number 2n = 28 + XY, holokinetic chromosomes, absence of m chromosomes and an achiasmatic male meiosis. Autosomes divide pre-reductionally while the
J Kapuscinski
Biotechnic & histochemistry : official publication of the Biological Stain Commission, 70(5), 220-233 (1995-09-01)
DAPI (4',6-diamidino-2-phenylindole) is a DNA-specific probe which forms a fluorescent complex by attaching in the minor grove of A-T rich sequences of DNA. It also forms nonfluorescent intercalative complexes with double-stranded nucleic acids. The physicochemical properties of the dye and
Christy A Itoga et al.
The Journal of comparative neurology, 527(15), 2474-2487 (2019-03-13)
Corticotropin-releasing hormone (CRH) is an essential, evolutionarily-conserved stress neuropeptide. In addition to hypothalamus, CRH is expressed in brain regions including amygdala and hippocampus where it plays crucial roles in modulating the function of circuits underlying emotion and cognition. CRH+ fibers
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