NGS文库制备

文库制备是新一代测序的第一步。在对DNA或RNA样本进行测序之前,必须先对核酸进行提取、片段化、末端修复,并通过连接或标签化方法将其与适配体共价连接。 一个制备良好的NGS文库,其复杂性应能全面、准确地反映样本的复杂性,但同时也反映了文库制备过程中引入的任何偏倚。 为新一代测序制备DNA或RNA文库的关键目标之一,是在最大限度提高复杂性的同时,减少PCR或其他扩增过程引入的偏差,因为最终文库的质量会显著影响NGS结果。
我们提供一系列 NGS 文库制备工具,旨在简化工作流程,并促进高质量 DNA 或 RNA 文库的制备,这些文库既能准确反映样本的复杂性,又能减少全基因组测序 (WGS)、全转录组分析 (WTA)、总 RNA 测序以及 miRNA 和小 RNA 测序应用中的偏差。
Products
基因组DNA提取试剂盒
为了制备DNA文库,需要从细胞、组织或其他样本中提取高分子量基因组DNA(gDNA)。纯化的基因组DNA应具有极小的断裂程度,且生物和化学污染物含量极低,以确保在后续扩增或测序反应中获得最佳性能。
Fire Monkey™/Fire Flower™ 高分子量 DNA 提取试剂盒可分离出高纯度的基因组 DNA,其链断裂程度极低,且低分子量核酸污染物含量极低。
- Fire Monkey™ 采用标准的离心柱法,可在 1 小时内从细菌或哺乳动物细胞中提取平均链长大于 100 kb 的高分子量 DNA。
- Fire Flower™ 采用标准的离心柱法,可在 15 分钟内对来自任何样本来源的提取 DNA 进行片段大小选择。Fire Flower™ 可在去除高达 30 kb 的 DNA 片段的同时,将整体平均链长提高 30%。
全基因组扩增试剂盒
DNA 序列分析通常受限于可用样本量少或提取收率低。当可获得的起始材料有限时,可采用扩增技术来增加起始 DNA 的量。全基因组扩增(WGA)可用于对完整和高度碎片化的 DNA 样本进行预扩增,以便输入到 NGS 工作流程中。
SeqPlex-I WGA 试剂盒可对少量 DNA 或降解、高度碎片化的 DNA 进行扩增,以便直接输入到 Illumina® 下一代测序(NGS)流细胞中。
- 支持仅需 100 pg DNA 即可进行测序
- 经过优化的引物可实现全基因组覆盖,将测序偏差降至最低,且扩增片段大小非常适合新一代测序(NGS)
- 经济高效:无需额外的 NGS 文库制备步骤
- 兼容 Illumina® 下一代测序
SeqPlex增强型DNA扩增试剂盒(用于全基因组扩增)旨在促进从极微量或降解/高度碎片化的DNA进行新一代测序。该试剂盒专为集成到Illumina®、SOLiD™或454测序工作流程而开发。
- 随机引物技术可扩增碎片化DNA,例如ChIP或FFPE样本
- 支持仅需100 pg的ChIP DNA即可进行测序
- 增强型引物可实现全基因组覆盖、最小化测序偏倚并便于去除引物
- 兼容 Illumina®、SOLiD™ 或 454 文库制备流程,适用于新一代测序
全转录组扩增试剂盒
制备RNA-Seq用NGS文库的主要目标是最大限度地提高转录组文库的复杂度,以充分代表起始序列池,同时减少偏倚。用于高通量基因表达谱和转录组分析的RNA-Seq通常面临起始RNA量不足的挑战。 全转录组扩增(WTA)技术可用于从少量RNA中生成足量的测序靶标,但这需要高保真度的转录本复制,且不得丢失或扭曲特定的mRNA,以减少文库偏倚。
SeqPlex-I WTA 试剂盒可对少量逆转录 RNA 或降解 RNA 进行扩增,以便直接输入到 Illumina® 下一代测序(NGS)流式细胞中。
- 可扩增碎片化或极微量的总RNA。利用随机引物技术,可轻松扩增来自所有来源(包括FFPE和RIP)的碎片化或完整RNA。
- 半退化文库引物设计可确保更全面的转录组覆盖和高效的引物结合
- 步骤更少:无需在测序前对cDNA进行片段化
- 高效率:8小时内即可扩增双链cDNA
- 经济高效:无需额外的 NGS 文库制备步骤
- 兼容 Illumina® 下一代测序
SeqPlex RNA 扩增试剂盒专用于全转录组扩增(WTA),旨在促进从少量或降解/高度碎片化的 RNA(例如来自福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本的 RNA)进行下一代测序(NGS)。 SeqPlex 试剂盒允许用户对 RNA 样本进行预扩增,以便将其输入到 NGS 工作流程中。
- 随机引物技术可扩增来自所有来源(包括 FFPE 和 RIP)的少量碎片化或完整 RNA。
- 采用半退化文库引物设计,以实现更全面的转录组覆盖和高效的引物结合。
- 测序前无需对 DNA 进行片段化处理。
- 在 8 小时或更短时间内扩增双链 cDNA。
- 与除 Pacific Bioscience 以外的所有新一代测序平台兼容。
相关资源
- 《分子基础指南》
了解我们的全面分子工具和试剂如何为您的工作流程提供精准、即用型解决方案。
- SeqPlex 增强型DNA扩增试剂盒 (SEQXE)实验方案
面向全基因组扩增(WGA)的SeqPlexDNA扩增试剂盒(SEQXE)专用于对极小量或降解/高度片段化的DNA进行下一代测序(NGS)。
- 定制新一代测序寡核苷酸
无论新一代测序 (NGS) 平台如何变化,都需要通用和索引接头序列来正确组装样品片段。
- 完整全转录组扩增试剂盒实验方案(WTA2)
WTA2是一种全转录组扩增(WTA)方法,可在不到4小时内对纳克级总RNA进行具有代表性的扩增,且不存在3-bias。
- SEQR – SeqPlex RNA扩增试剂盒实验方案
SeqPlex RNA扩增试剂盒可在进入常用深度测序平台工作流程之前为总RNA或分离后的mRNA提供一种扩增方法,
- Whole Transcriptome Amplification of RNA from Low Cell-Number Samples
The efficacy of amplification of small quantities of total RNA with the Complete Whole Transcriptome Amplification Kit (WTA2) was examined in this study.
- Whole Genome Amplification for Single Cell Biology
Whole genome amplification overcomes restrictions for single-cell genomic analyses with non-specific amplification.
- 用于商业用途的定制寡核苷酸
从初期研究到商业化上市,我们提供专业的项目支持,确保您的成功。