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Dosages de l'activité enzymatique

Schéma illustrant le clivage enzymatique impliquant la BACE 1 et l'extinction de la fluorescence. Trois étapes sont représentées : (1) le donneur de fluorescence lié à l'accepteur d'extinction, (2) le clivage enzymatique par la BACE 1, et (3) l'augmentation de la fluorescence due à l'élimination de l'extincteur.

Figure 1.Représentation du processus de test de l'activité enzymatique commençant par un donneur de fluorescence et un accepteur d'extinction sur un substrat subissant une coupure enzymatique pour éliminer l'extincteur, montrant une augmentation de l'activité fluorescente qui signale la présence d'une activité enzymatique.

Les tests d'activité enzymatique sont principalement réalisés par des chercheurs afin d'identifier la présence ou la quantité d'une enzyme spécifique dans un organisme, un tissu ou un échantillon. Parmi ces enzymes, on peut citer l'α-amylase, la catalase, la laccase, la peroxydase, le lysozyme et les enzymes rapporteuses phosphatase alcaline et luciférase. Il existe une grande variété de réactifs et de méthodologies permettant d'étudier les interactions spécifiques entre les enzymes et leurs substrats. Le choix d'une solution de workflow appropriée dépend de la sensibilité requise par le chercheur. Les solutions colorimétriques sont utiles pour la détection, tandis que les réactifs à base de fluorescence sont mieux adaptés à la quantification de l'activité enzymatique.



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Détermination des conditions optimales pour l'activité enzymatique

Bien que de nombreux tests enzymatiques aient été décrits dans la littérature, il est nécessaire d'adapter ces procédures aux exigences spécifiques de l'enzyme étudiée. L'activité spécifique d'une enzyme dépend de nombreux facteurs, notamment le pH, la température, la force ionique et la concentration de tous les composants du test. Pour des conditions telles que le pH, l'activité enzymatique ressemble souvent à une courbe en cloche. L'activité la plus élevée à un pH spécifique est rapportée comme laVmax, avec une activité décroissante observée à chaque extrémité de la courbe. Certaines enzymes peuvent nécessiter des considérations supplémentaires pour les composés qui ne sont pas directement impliqués dans la réaction, tels que les ions métalliques, les détergents et les molécules hydrophobes.

Détermination des conditions optimales pour l'activité enzymatique

Bien que de nombreux tests enzymatiques aient été décrits dans la littérature, il est nécessaire d'adapter ces procédures aux exigences spécifiques de l'enzyme étudiée. L'activité spécifique d'une enzyme dépend de nombreux facteurs, notamment le pH, la température, la force ionique et la concentration de tous les composants dans le test. Pour des conditions telles que le pH, l'activité enzymatique ressemble souvent à une courbe en cloche. L'activité la plus élevée à un pH spécifique est rapportée comme laVmax, avec une activité décroissante observée à chaque extrémité de la courbe. Certaines enzymes peuvent nécessiter des considérations supplémentaires pour les composés qui ne sont pas directement impliqués dans la réaction, tels que les ions métalliques, les détergents et les molécules hydrophobes.

Composants du test enzymatique

Pour de nombreuses enzymes, l'eau est le solvant standard, car elle correspond à l'environnement aqueux présent dans les cellules. Cependant, des solvants organiques sont utilisés dans certains cas où les enzymes ou les composants enzymatiques sont insolubles dans l'eau. De plus, les substrats et les cofacteurs, qui catalysent les réactions enzymatiques, sont également des composants essentiels d'un test d'activité enzymatique. Les substrats et les cofacteurs sont souvent identifiés en fonction de leurs fonctions dans des conditions physiologiques. À ce titre, les substrats et les cofacteurs interagissent largement et peuvent être nécessaires à un large éventail d'enzymes. Les tampons et les ions sont d'autres éléments essentiels à prendre en compte, car ils sont indispensables pour stabiliser le pH tout au long du test et influencent directement l'activité enzymatique. Par exemple, des ions métalliques mono- ou divalents peuvent être nécessaires à l'activité catalytique des cofacteurs dans la réaction et sont essentiels à l'activité enzymatique.

Réalisation d'un test enzymatique

La préparation des composants du test enzymatique est une première étape pratique. Il est généralement avantageux de préparer un mélange de test volumineux, à l'exception d'un composant activateur, afin d'éviter les erreurs de pipetage inhérentes au pipetage de petits volumes. Une fois le mélange de test préparé, les chercheurs ajoutent le composant activateur final au mélange pour lancer le test d'activité. Le prétraitement des enzymes, qui consiste à les conserver à basse température et à y ajouter souvent divers additifs chimiques ou protéiques, est un facteur essentiel pour garantir la stabilité et l'activité maximale des enzymes avant le début du test. Une fois les matériaux de réaction combinés dans un récipient d'observation, tous les composants doivent être mélangés rapidement et soigneusement dès le début de la réaction. L'enregistrement des données doit commencer immédiatement après le mélange, et le signal détectable du test doit être représenté graphiquement pour toute la durée de la réaction.

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