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ABE1889

抗ZMYND11抗体

serum, from rabbit

別名:

Zinc finger MYND domain-containing protein 11

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この商品について

UNSPSC Code:
12352203
NACRES:
NA.41
eCl@ss:
32160702
Conjugate:
unconjugated
Clone:
polyclonal
Application:
ChIP, WB
Citations:
-
テクニカルサービス
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biological source

rabbit

Quality Segment

conjugate

unconjugated

antibody form

serum

antibody product type

primary antibodies

clone

polyclonal

species reactivity

human

species reactivity (predicted by homology)

mouse (based on 100% sequence homology)

technique(s)

ChIP: suitable (ChIP-seq), western blot: suitable

NCBI accession no.

UniProt accession no.

shipped in

dry ice

target post-translational modification

unmodified

Gene Information

mouse ... Zmynd11(66505)

General description

プロテイン11含有ジンクフィンガーMYNDドメイン(UniProt Q8R5C8)は、マウス種のZmynd11遺伝子(Gene ID 66505)によってコードされています。ZMYND11/BS69は、アデノウイルスE1Aおよびc-MybやETS-2などの腫瘍性タンパク質を含む細胞転写因子の共役制御因子として機能します。ZMYND11には、いくつかのヒストンリーダーモチーフが含まれており、その中には植物ホメオドメイン(PHD)ならびにブロモドメインやPWWPドメインがあります。Lys36トリメチル化ヒストンH3(H3K36me3)は、RNAポリメラーゼII伸長後に転写された領域においてヌクレオソーム上に蓄積し、ZMYND11は、特異的にH3K36me3を認識して、RNAポリメラーゼII伸長を制御することが分かっています。吸着試験では、結合PHDブロモPWWP(PBP)モジュールがZMYND11によるH3K36me3の認識を媒介し、PWWPドメイン単独では、H3K36me、H3K36me2、非メチル化H3K36に対する親和性はほとんどまたはまったく認められないことが明らかになりました。ZMYND11は腫瘍抑制因子であり、伸長段階のRNAポリメラーゼIIを調節することで特殊な転写共役制御因子として機能します。乳がん患者においてZMYND11の発現レベルが低いことは、予後不良と相関しています。一貫して、ZMYND11の過剰発現は、in vitroではがん細胞増殖を、in vivoではマウスにおける腫瘍形成を抑制します。
実測値:約70 kDa。算出値:70.96 kDa(アイソフォーム1)、64.43 kDa(アイソフォーム2)、66.59 kDa(アイソフォーム3)、60.05 kDa(アイソフォーム4)、60.87 kDa(アイソフォーム5)、66.52 kDa(アイソフォーム6)。

Immunogen

Hisタグ付きリコンビナントマウスZMYND11 C末端フラグメント。
エピトープ:C末端領域

Application

この抗ZMYND11抗体を用いたZMYND11の検出は、ウェスタンブロッティング、クロマチン免疫沈降(ChIP)、ChIP-seqでの使用が検証されています。
ウェスタンブロッティング:希釈倍率1:1,000で使用、ZMYND11 shRNA処理後のヒト骨肉腫U2OS細胞核抽出物中で下方制御されたZMYND11レベルを検出できます(テキサス州テキサス大学MDアンダーソンがんセンターHong Wen博士のご厚意による提供)。
クロマチン免疫沈降:ヒト骨肉腫U2OS細胞核抽出物を用いてChIPによりc-Myc遺伝子のZMYND11占有率を検出できます。ZMYND11 shRNA処理は、ChIPにおいてc-Myc遺伝子断片を大幅に減らしました(テキサス州テキサス大学MDアンダーソンがんセンターHong Wen博士のご厚意による提供)。
クロマチン免疫沈降(ChIP):ヒト骨肉腫U2OS細胞由来のクロマチン調製物を用いるChIPにより、ZMYND11のクロマチン占有率を検出できます。SETD2ノックダウンによる H3K36me3レベルの低下により、ZMYND11と標的遺伝子との関連性が低下しました(Wen, H., et al. (2014)。Nature.508(7495):263-268)。
ChIP-seq解析:ヒト骨肉腫U2OS細胞由来のクロマチン調製物を用いるゲノムワイドChIP-seq解析により、ZMYND11標的クロマチン部位を検出できます。ZMYND11占有部位は、イントロンとエクソンが非常に豊富ですが、標的遺伝子のプロモーターは豊富に含まれていません(Wen, H., et al. (2014)。Nature.508(7495):263-268)。
ウェスタンブロッティング:酵母およびQT-6Aウズラ線維芽細胞において外因的に発現させたヒトBS69タンパク質を検出できます(Ladendorff, N.E., et al. (2001)。Oncogene.20(1):125-132)。
研究のサブカテゴリ
クロマチン生物学
研究カテゴリー
エピジェネティクス・核内機能分子&

Biochem/physiol Actions

この抗血清は、U2OS核抽出物のウェスタンブロッティングにより2つの免疫反応バンドを検出します。ZMYND11 shRNA処理により約70 kDaのバンドが特異的に消失しましたが、約60 kDaのバンドは消失しませんでした。ウェスタンブロッティングによるZMYND11以外のバンドの検出は、クロマチン免疫沈降(ChIP)用途におけるこの抗血清の性能に影響を及ぼしません。′ChIPの前のshRNA処理によるZMYND11ノックダウンにより、shRNA未処理細胞からの免疫沈降においてDNA断片の存在が消失しました。さらに、この抗血清を用いて得られたChIPプロファイルは、抗FLAG抗体およびFLAGタグ付きZMYND11を発現する細胞を用いて得られたものに非常に似ています。

Physical form

0.05%アジ化ナトリウムを含有する血清ウサギポリクローナル抗体。
未精製

Preparation Note

-20°Cで受領日から1年間安定です。
取扱い推奨事項:25 μLのろ過された実験室グレードの水またはPBSを加えて溶解します。微小遠心管に分注してから、-20°Cで保存してください。凍結融解を繰り返さないでください。IgGに損傷を与える、または製品性能に影響を及ぼすおそれがあります。

Analysis Note

U2OS核抽出物のウェスタンブロッティングで評価されています。

ウェスタンブロッティング:希釈倍率1:500で使用、20 µgのU2OS核抽出物においてZMYND11を検出できます。

Other Notes

濃度:ロットに固有のデータシートを参照してください。

Disclaimer

メルクのカタログまたは製品に添付されたメルクのその他の文書に記載されていない場合、メルクの製品は研究用途のみを目的としているため、他のいかなる目的にも使用することはできません。このような目的としては、未承認の商業用途、in vitroの診断用途、ex vivoあるいはin vivoの治療用途、またはヒトあるいは動物へのあらゆる種類の消費あるいは適用などがありますが、これらに限定されません。


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保管分類

12 - Non Combustible Liquids

wgk

WGK 1

flash_point_f

Not applicable

flash_point_c

Not applicable



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