KiCqStart^® プローブアッセイ

概要
デザイン済みKiCqStartプローブアッセイは、RT-qPCR（定量的逆転写リアルタイムPCR）遺伝子発現の定量に使用されます。MIQEを遵守するために、これらのアッセイはオフターゲット増幅を避けることを目的として高度なバイオインフォマティクスツールおよびバリデーション済みのin silico手法を用いて開発されました¹。KiCqStartプローブアッセイは、一般モデル生物由来の遺伝子分析用に、最大3組の順方向プライマー、逆方向プライマーおよび二重標識プローブの形でお届けします。

^{デザインプロセスでは、できる限り1}SNP座位を回避しています。回避できないSNPがある遺伝子を分析する場合には、dbSNPを使用してください。

KiCqStartプローブアッセイの詳細については、メルクサイトのよくある質問をご利用ください。

規格
デザイン特性

• GC内容：20～80%²
• 融点：58.0°C²
• 2次構造：なし
• 過剰3′プライマー固定：最小
• 増幅産物サイズ：75～150塩基
• 検出されたスプライスバリアント：最多

オリゴ特性（プライマー）

• 分子：DNA（すべての配列を質量分析QCで検証）
• 内部修飾：なし
• 内容：順方向プライマー1、逆方向プライマー1
• 長さ：18～27塩基²
• 精製：RPカートリッジ
• フォーマット：最小収量3 OD、乾量。チューブ2本、各チューブにオリゴヌクレオチド1

オリゴ特性（プローブ）

• 分子：DNA（すべての配列を質量分析QCで検証）
• 内部修飾：なし
• 5′レポーター色素：6-FAMまたはHEX

製品使用目的: 遺伝子発現解析

Product Specifications
Design Characteristics

• Exon-exon junction targeting: Assays are designed to span exon-exon junctions whenever possible, minimizing the risk of amplifying genomic DNA rather than the intended mRNA target. In cases where a suitable junction design is not available, a coding-region design is used as a fallback.
• SNP-aware design: Known single nucleotide polymorphism (SNP) positions are excluded during primer and probe design, so assays avoid sites of common genetic variation. This helps ensure consistent performance across samples from different individuals.
• Optimized amplicon size: Amplicons range from 75-200 bp, with most final assays falling between 75-150 bp, a size range well-suited for efficient, specific qPCR amplification.
• Transcript (isoform) coverage: Assays are designed to capture as many known transcript variants of a gene as possible.
• Secondary-structure screening: Probe sequences are computationally screened for a tendency to fold into secondary structures (e.g., hairpins) that could interfere with binding. Probes are filtered based on thermodynamic stability calculations to favor those less likely to form these structures.

Oligonucleotide Characteristics: Primer

• Molecule: DNA
• Purification: Desalt

Oligonucleotide Characteristics: Dual-LabeledProbe

• Molecule: DNA
• 5′ Reporter Dye: 6-FAM^™or HEX^™
• 3′ Quencher: Minor Groove Binder / Eclipse Dark Quencher (MGB:EDQ)
• Purification: HPLC

Product Format

• Components: Forward primer, reverse primer, and MGB:EDQ probe, available individual tubes or pre-mixed in a single clear tube.
• Coverage: All protein-coding genes.
• Shipping format: Sizes include – small (individual tubes, dry: ~2,200 rxn or pre-mixed in one tube dry @20X: 1,000 rxn), medium (individual tubes, dry: ~3,700 rxn), or large (individual tubes, dry: ~7,500 rxn).
• Storage temperature: −20 °C

KiCqStart^®プローブアッセイは、高感度で特異的であり、効率的なプローブベースのRT-qPCRアッセイ開発に必要とされる冗長なステップをなくすことで時間と費用を節約します。このプローブは、Sigmaのdark Onyx Quencher^™ （OQ^™）で標識されており、これは光ではなく熱を発するため、従来の蛍光クエンチャーと比較してシグナル対ノイズ比が改善されています。

これらのアッセイの利点としては以下があります：

• 標的分析が行えます
• デザイン特性が設定されています
• オリゴ特性が設定されています
• 注文が簡単です

How to Order

1. Search by species and your gene of interest by gene name, gene symbol, or RefSeq accession number using the assay search tool above.
2. Select your assay and format from the results.
3. Add to cart.

For bulk orders, custom panel requirements, or assistance with gene target selection, please contact your local Merck representative.

6-FAM and HEX are trademarks of ThermoFisher Scientific.

FAM is a trademark of Applera Corporation or its subsidiaries in the US and/or certain other countries

HEX is a trademark of Applera Corporation or its subsidiaries in the US and/or certain other countries