Microbiome

Recherche sur le microbiome

Dans le domaine émergent de la recherche sur le microbiome, les scientifiques sont confrontés au défi d’identifier et de caractériser des microbes inconnus qui peuvent être difficiles à isoler, à cultiver et à étudier. Les applications des analyses du microbiome humain, animal et environnemental pourraient déboucher sur la découverte de nouveaux produits thérapeutiques et naturels. Nos scientifiques mettent au point de nouvelles solutions pour vous aider à cultiver et/ou à identifier des microbes en vue de la caractérisation des communautés microbiennes.

Pour faciliter la découverte de nouveaux microbes, nous proposons :

• MetaPolyzme pour la digestion des microbes difficiles et l’isolement de l’ADN total
• Des enzymes sans ADN pour une analyse exempte de contamination
• Des anticorps hautement spécifiques aux bactéries et à leurs composants
• Des étalons d’ADN individuels et des bactéries inactivées pour éviter les biais et améliorer la reproductibilité

Milieux de culture
microbiens

Les micro-organismes ont des besoins nutritionnels variés, des métabolismes différents, sont inhibés par divers composés et ne peuvent souvent être détectés qu’à l’aide de systèmes indicateurs spécifiques. Les milieux sélectifs permettent la croissance de certaines espèces ou souches présentant des caractéristiques spécifiques, tandis que les milieux de culture non sélectifs favorisent la croissance d’un large éventail d’organismes. Les milieux dotés d’un système de différenciation peuvent être utilisés pour identifier ou, à tout le moins, différencier les micro-organismes les uns des autres. Pour la caractérisation des communautés microbiennes et la préparation d’ADN, nous proposons une large gamme de milieux de culture microbiens et de matières premières.

Normes relatives au microbiome

La technologie de séquençage de nouvelle génération (NGS) a facilité le séquençage de l’ADN microbien à grande échelle, permettant ainsi l’analyse d’échantillons de microbiomes complexes. Afin d’éviter tout biais et d’assurer la reproductibilité des analyses de microbiomes, la normalisation est essentielle. Elle est la clé de l’avenir de la recherche sur les microbiomes et la métagénomique, capable de générer des données précises et valides.

Nous proposons une liste croissante d’étalons microbiomiques individuels à base d’ADN microbien et de bactéries inactivées, adaptés à la PCR, au séquençage et au NGS. Ces étalons individuels pratiques et prêts à l’emploi apportent une valeur ajoutée en fournissant un contrôle spécifique et personnalisé. Ces étalons économiques facilitent les flux de travail en microbiomique ou en métagénomique en améliorant la reproductibilité et en permettant une comparaison fiable des résultats avec ceux d’autres laboratoires.

Anticorps pour la recherche sur le microbiome

Notre gamme d’anticorps destinés à l’analyse du microbiome comprend des anticorps hautement spécifiques qui se lient à des bactéries ou à des composants bactériens (par exemple, des toxines, des protéines spécifiques et des lipopolysaccharides), adaptés à diverses applications de détection et d’isolement de bactéries spécifiques. Les principales applications d’immunodétection comprennent l’ELISA, le Western blot (WB), l’imagerie et l’isolement.

Enzymes lytiques sans ADN pour la recherche sur le microbiome

L’étude des communautés microbiennes a été révolutionnée ces dernières années par l’adoption généralisée de techniques d’analyse indépendantes de la culture, telles que le séquençage du gène de l’ARNr 16S et la métagénomique. La contamination par l’ADN lors de la préparation des échantillons constituant un facteur de confusion majeur pour ces approches basées sur le séquençage, l’utilisation de réactifs d’extraction d’ADN exempts de contaminants d’ADN est essentielle. Un autre défi majeur dans le traitement des échantillons de microbiome réside dans la difficulté à désagréger les microbes : leurs parois cellulaires peuvent former des capsules ou des spores résistantes lors du traitement. L’ADN peut être extrait des microbes à l’aide d’enzymes de lyse afin de provoquer la formation partielle de sphéroplastes. Ces sphéroplastes sont ensuite lysés pour libérer l’ADN. Les enzymes lytiques purifiées sont soumises à des tests de contrôle qualité rigoureux afin de garantir qu’elles sont exemptes de contaminants d’ADN et donc adaptées à la recherche sur le microbiome.

Kits de purification de l’ADN du microbiome

Afin d’étudier le rôle du microbiote dans la santé humaine, animale et environnementale, il est indispensable d’obtenir des données microbiennes précises et reproductibles. Il est donc essentiel d’appliquer une méthodologie appropriée pour l’extraction de l’ADN microbien. La mise en place d’une procédure optimale d’isolation de l’ADN est cruciale pour la robustesse et la reproductibilité des résultats, car une extraction d’ADN inefficace peut entraîner une caractérisation erronée de la communauté microbienne. Nos kits de purification d’ADN offrent des méthodes pratiques et rapides pour isoler de l’ADN microbien de haute qualité et à haut rendement à partir d’échantillons variés.