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Merck

A0701

Agarose, faible température de gélification

Type VII-A

Synonyme(s) :

2-hydroxyéthyl agarose

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A propos de cet article

Numéro CAS:
39346-81-1
UNSPSC Code:
41105317
NACRES:
NA.21
MDL number:
MFCD00081294

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SMILES string

O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O

InChI

1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1

InChI key

MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

type

Type VII-A

form

powder

technique(s)

electrophoresis: suitable

impurities

≤7% water

ash

≤0.4%

turbidity

≤4 NTU (1.5% gel)

EEO

≤0.12

mp

65 °C±1 °C

transition temp

gel point 26 °C ±2 °C (1.5% gel)

gel strength

≥250 g/cm2 (1% gel)

anion traces

sulfate (SO42-): ≤0.4%

Quality Level

200

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General description

Agarose is a polymer extracted from agar or agar-bearing marine algae. This purified linear galactan hydrocolloid comprises alternating co-polymers D-galactose and 3,6-anhydro-L-galactopyranose units connected by α-(1→3) and β-(1→4) glycosidic bonds. Agarose is highly biocompatible due to its variable mechanical and diffusion properties.

Application

Excellent for in-gel enzymatic reactions and cloning assays and for recovery of heat-labile samples after electrophoresis
Agarose has been used:
  • to encapsulate Escherichia coli on a hydrogel in tissue culture
  • to entrap Aliivibrio fischeri on a disposable card involved in designing of toxicity biosensors
  • as a the dispersed phase of emulsion during preparation agar beads

Biochem/physiol Actions

Agarose can be used as a gelling agent, to separate nucleic acids electrophoretically because its gels have larger pore sizes than polyacrylamide gels at low concentrations. Unlike polyacrylamide, the consistency of the gels is more solid (but also less elastic) It is also employed to determine cross reaction in immunoelectrophoresis (IEP) and Ouchterlony (double diffusion) plates in which antibody-antigen precipitin lines are studied. Agarose is used to make gel plates or overlays for cells in tissue culture. In addition, it is also used to form a gel matrix (either beaded and/or crosslinked) which can be used in chromatographic separations.

Analysis Note

Nos agaroses ont les propriétés suivantes :
Teneur en sulfates : sert d'indicateur de pureté, le sulfate étant le principal groupement ionique présent.
Force du gel : équivaut à la force qu'il faut appliquer sur le gel pour le rompre.
Point de gélification : correspond à la température à laquelle une solution aqueuse d'agarose forme un gel en refroidissant. Les solutions d'agarose présentent une hystérésis lorsqu'elles passent de la forme liquide à la forme gélifiée, ce qui signifie que leur point de gélification n'est pas égal à leur température de fusion.
Électro-endosmose (EEO) : définit un mouvement de liquide à travers le gel. Les groupements anioniques d'un gel d'agarose sont fixés à la matrice et ne peuvent pas bouger, mais les contre-ions positifs dissociables peuvent migrer dans la matrice en direction de la cathode, créant ainsi une EEO. Comme le déplacement électrophorétique des biopolymères se fait généralement vers l'anode, l'EEO peut perturber les séparations en raison d'une convection interne.

Other Notes

Discover LiChropur reagents ideal for HPLC or LC-MS analysis

Classe de stockage

11 - Combustible Solids

wgk

WGK 3

flash_point_f

Not applicable

flash_point_c

Not applicable

ppe

Eyeshields, Gloves, type N95 (US)

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Certificats d'analyse (COA)

Lot/Batch Number
0000534591
0000534594
0000534591
0000534594
0000515922

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Design of a toxicity biosensor based on Aliivibrio fischeri entrapped in a disposable card
Jouanneau, S, et al.
Environmental Science and Pollution Research International, 23(5), 4340-4345 (2016)
Mahmoud Affi et al.
Analytical and bioanalytical chemistry, 408(30), 8761-8770 (2016-04-05)
Water quality and water management are worldwide issues. The analysis of pollutants and in particular, heavy metals, is generally conducted by sensitive but expensive physicochemical methods. Other alternative methods of analysis, such as microbial biosensors, have been developed for their
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