qPCR

定量的リアルタイムPCR(qPCR)は、蛍光レポーター分子を用いて増幅産物の定量を行う手法です。従来のPCRと同様に、DNA、cDNA、またはRNAのテンプレートが増幅されますが、各サイクルごとに蛍光シグナルをモニタリングし、相対的または絶対的な定量を行います。
この手法は、遺伝子発現解析、ジェノタイピング、マイクロRNA解析、遺伝的変異解析、タンパク質解析など、数多くの研究分野で有用です。
注目のカテゴリー
昆虫、細菌、および哺乳類由来のタンパク質発現ベクターを用いた、信頼性の高いクローニングと安定したタンパク質発現を実現するための分子クローニングおよびタンパク質発現の方法とプロトコル。
qPCRデータの解析方法
レポーター分子の蛍光を測定・定量します。通常、これらは二本鎖DNAの塩基間に挿入される色素(例:SYBR® Green、エチジウムブロマイド)か、DNA上の特定の配列に結合するように設計されたプローブ(例:モレキュラービーコン、TaqMan®プローブ)のいずれかです。
qPCRデータの相対定量
qPCRデータの定量には、主に2つの方法があります。より一般的な方法である相対定量では、ΔΔCt情報を用いて、対照遺伝子と比較したサンプル中の標的遺伝子の発現量または存在量の比率を決定し、参照遺伝子の発現比率で正規化します。標的遺伝子と参照遺伝子の効率(E値)は異なるため、この方法ではE値の差も考慮されます。この方法は、遺伝子発現解析においてより頻繁に採用されています。
qPCRデータの絶対定量
2つ目の手法である絶対定量は、環境微生物学においてより一般的であり、標準曲線(SC)を利用する。 SC法では、既知のテンプレート濃度N0の希釈系列を用い、log(N0)対CT(閾値サイクル)の線形回帰によって標準曲線を作成します。これをもとに、サンプルのテンプレート濃度を算出します。この手法の基礎となるのは、サンプルの効率値が標準試料の効率値と同じであるという仮定です。
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