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この商品について
UNSPSC Code:
12352203
NACRES:
NA.41
eCl@ss:
32160702
Clone:
21A7, monoclonal
Species reactivity:
human
Application:
ChIP, ELISA, WB
Citations:
12
biological source
mouse
Quality Segment
antibody form
purified immunoglobulin
antibody product type
primary antibodies
clone
21A7, monoclonal
species reactivity
human
species reactivity (predicted by homology)
nonhuman primates (based on 100% sequence homology), Xenopus (based on 100% sequence homology), bovine (based on 100% sequence homology), mouse (based on 100% sequence homology), rat (based on 100% sequence homology)
technique(s)
ChIP: suitable (ChIP-seq), ELISA: suitable, western blot: suitable
isotype
IgG2bκ
NCBI accession no.
UniProt accession no.
shipped in
ambient
target post-translational modification
acetylation (Lys105/Lys106)
Gene Information
human ... SMC3(9126)
General description
Structural maintenance of chromosomesタンパク質3(UniProt Q9UQE7)(別名:Bamacan、Basement membrane-associated chondroitin proteoglycan、Chondroitin sulfate proteoglycan 6、Chromosome-associated polypeptide、hCAP、SMC protein 3、SMC-3)は、ヒトSMC3(別名:BAM、BMH、CDLS3、CSPG6、SMC3L1)遺伝子(Gene ID 9126)によってコードされています。コヒーシンは、Rad21と2つのstructural maintenance of chromosomesタンパク質(SMC1、SMC3)で構成される核三分子複合体です。コヒーシンは、姉妹染色分体接着ならびにDNA修復と遺伝子発現制御において重要な役割を担っています。S期において姉妹染色分体接着を確立するために、SMC3は、2つのコヒーシンアセチルトランスフェラーゼ(CoAT)であるESCO1とESCO2によりアセチル化されます(ヒトではK105とK106において)。この2つのCoATは、N末端ドメインと発生中および細胞周期全体における発現に違いがあります。ChIP-seqにより、長期クロマチン相互作用を媒介し、転写を包括的に制御するコヒーシンおよびCTCFにより占有されている11,000を超えるクロマチン部位にコヒーシンによってESCO1が動員されることが分かります。一方、ESCO2は、神経特異的遺伝子の転写を抑制するREST/NRSF(RE1-silencing transcription factor/neuron-restrictive silencer factor)により標的とされる部位において濃縮されることはまれです。SMC3のアセチル化は、S期の二量体のヒンジ構造の立体構造変化を誘発し、二量体が開き、DNAを搭載できるようにします。
実測値:約160 kDa。算出値:142.0/141.5/141.6/138.4/140.7 kDa(ウシ/ヒト/マウス/ラット/ツメガエル)。一部のライセートでは、特性が明らかになっていないバンドが認められることがあります。
Immunogen
アセチル化されたLys105とLys106を含むヒト/マウス/ラットSMC3の標的領域配列に相当するKLH結合直鎖ペプチド。
Application
ELISA:Lys105/106がジアセチル化されたSMC3ペプチドには、Lys105がモノアセチル化されたSMC3ペプチドの2倍の親和性で結合し(それぞれKd = 0.04と0.09 µg/mL)ますが、Lys105がモノアセチル化されたペプチドに対しては親和性が大幅に低下しており(Kd = 0.73 µg/mL)、非アセチル化ペプチドに対してはほとんど親和性がありません(Kd = 2.99 µg/mL)(Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275)。
クロマチン免疫沈降(ChIP):HDAC8-null HCT116細胞において、野生型HCT-116細胞との比較における、標的クロマチン部位におけるSMC3占有率の上昇を検出できます cells (Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275)。
ChIP-seq:Rad21標的部位の81%およびEsco1標的部位の70%が含まれるSMC3の11番染色体における濃縮部位をChIP-seqにより検出できます(Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275)。
ウェスタンブロッティング:HeLa細胞においてSMC3のLys105/106アセチル化を検出できます。shRNA処理によるESCO1またはESCO2の欠乏は、SMC3のLys105/106アセチル化レベルを低下させた一方、ESCO1/2の二重欠乏は、最も顕著なSMC3 Lys105/106アセチル化低下を引き起こしました(Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).
クロマチン免疫沈降(ChIP):HDAC8-null HCT116細胞において、野生型HCT-116細胞との比較における、標的クロマチン部位におけるSMC3占有率の上昇を検出できます cells (Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275)。
ChIP-seq:Rad21標的部位の81%およびEsco1標的部位の70%が含まれるSMC3の11番染色体における濃縮部位をChIP-seqにより検出できます(Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275)。
ウェスタンブロッティング:HeLa細胞においてSMC3のLys105/106アセチル化を検出できます。shRNA処理によるESCO1またはESCO2の欠乏は、SMC3のLys105/106アセチル化レベルを低下させた一方、ESCO1/2の二重欠乏は、最も顕著なSMC3 Lys105/106アセチル化低下を引き起こしました(Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).
抗アセチルSMC3(Lys105/106)、クローン21A7(カタログ番号MABE1073)は、特異性の高いマウスモノクローナル抗体であり、SMC3 Lys105/106アセチル化を標的とし、クロマチン免疫沈降(ChIP)、 ChIP-seq、ELISA、ウェスタンブロッティングにおいて検証されています。
研究カテゴリー
エピジェネティクス・核内機能分子&
エピジェネティクス・核内機能分子&
Biochem/physiol Actions
クローン21A7は、Lys105/106がジアセチル化されたSMC3ペプチドには、Lys105がモノアセチル化されたSMC3ペプチドの2倍の親和性で結合し(それぞれKd = 0.04と0.09 µg/mL)ますが、Lys105がモノアセチル化されたペプチドに対しては親和性が大幅に低下しており(Kd = 0.73 µg/mL)、非アセチル化ペプチドに対してはほとんど親和性がありません(Kd = 2.99 µg/mL)(Rahman, S., et al. (2015).Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).
Physical form
フォーマット:精製
精製プロテインG。
精製マウスIgG2b抗体、150 mM NaCl、0.05% sodium azide含有0.1 M Tris-Glycineバッファー(pH 7.4)に溶解。
Preparation Note
2~8°Cで受領日から1年間安定です。
Analysis Note
ヒト網膜上皮色素(REP)細胞においてウェスタンブロッティングで評価済み。
ウェスタンブロッティング:希釈倍率1:1,000で使用、N-アセチルトランスフェラーゼESCO1をノックアウトしたヒト網膜上皮色素(REP)細胞からのライセート10 µgにおいて、野生型REP細胞からのライセートと比べて減少したSMC3 Lys105/106アセチル化を検出できます。
ウェスタンブロッティング:希釈倍率1:1,000で使用、N-アセチルトランスフェラーゼESCO1をノックアウトしたヒト網膜上皮色素(REP)細胞からのライセート10 µgにおいて、野生型REP細胞からのライセートと比べて減少したSMC3 Lys105/106アセチル化を検出できます。
Other Notes
濃度:ロットに固有のデータシートを参照してください。
Disclaimer
メルクのカタログまたは製品に添付されたメルクのその他の文書に記載されていない場合、メルクの製品は研究用途のみを目的としているため、他のいかなる目的にも使用することはできません。このような目的としては、未承認の商業用途、in vitroの診断用途、ex vivoあるいはin vivoの治療用途、またはヒトあるいは動物へのあらゆる種類の消費あるいは適用などがありますが、これらに限定されません。
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保管分類
12 - Non Combustible Liquids
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