MetaPolyzyme

メタゲノミクス解析は、特定の1試料（例えば環境試料、生物）から直接単離した全DNAを調べています。 メタゲノミクスにより、あらゆる環境（極限環境を含む）に存在し、歴史的に単離、培養及び研究が困難であった微生物の調査が可能となります。 メタゲノミクスにより、新たな微生物種の存在が明らかにされています。 メタゲノム研究の応用には、公衆衛生データ解析、新規タンパク質、酵素及び天然物質の発見、環境研究並びに農学的調査が含まれます。

MetaPolyzymeは、メタゲノミクス研究のための全DNAの単離を目的とした6種類の酵素の混合物です。 S. Tigheによる初期の方法²を改訂し、Association of Biomolecular Resource Facilities （ABRF）のMetagenomics and Microbiome Research Group（MMRG）と共同してMetaPolyzymeを評価・開発しました。MetaPolyzymeの使用に関する試験データは、2017 ABRF MGRGポスターで入手できます。

微生物の細胞壁は莢膜又は耐性のある芽胞を形成している場合があるため、細胞の分解は困難です。 DNAは、溶解酵素（リチカーゼ又はキチナーゼなど）を使用することにより抽出可能となり、部分的なスフェロプラスト形成をもたらします。 その後、スフェロプラストは溶解されDNAを遊離します。 MetaPolyzymeは、極限環境及び特殊環境下の微生物及びマイクロバイオームの研究などのメタゲノム研究に使用することを目的としています。 MetaPolyzymeは、メタゲノミクス及びメタトランスクリプトミクスの全ゲノムショットガンシークエンシングによる評価のため、微生物分解に使用することを目的としています。

1ユニットは、37°CでpH 8.0の緩衝液に懸濁した場合、600 nmでの濁度検出により1分間に0.4 μgのMicrococcus lysodeikticusを溶解します。

MetaPolyzyme中の酵素は、

• アクロモペプチダーゼ
• キチナーゼ
• リチカーゼ
• リゾスタフィン
• リゾチーム
• ムタノリシンです。