Purification des échantillons

Diverses méthodes de purification chimiques et physiques peuvent être utilisées pour séparer ou concentrer un analyte cible avant l'analyse. Parmi celles-ci figurent l'absorption, l'adsorption, la chromatographie, la distillation, l'extraction, l'échange d'ions, la filtration, la formation de complexes, la cristallisation, le séchage, et bien d'autres encore. La préparation de l'échantillon avant l'analyse permet de le mettre dans un format compatible avec la technique d'analyse, de réduire sa complexité, d'éliminer les impuretés gênantes et de concentrer l'analyte avant l'analyse. Une préparation appropriée de l'échantillon évitera le colmatage, pourra réduire la nécessité de procédures de lavage rigoureuses et pourra prolonger la durée de vie du support chromatographique.
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Dispositifs d'ultrafiltration centrifuge et sous pression destinés à la concentration de protéines, au dessalement, à l'échange de tampons, à la séparation et à la diafiltration d'échantillons biologiques et environnementaux en vue d'applications en aval.
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Certaines des techniques de purification les plus courantes présentées ci-dessous sont utilisées en laboratoire pour préparer les échantillons en vue d'analyses ultérieures.
Dialyse
La dialyse est une technique de purification utilisée pour éliminer le sel ou d'autres molécules de faible poids moléculaire d'un échantillon. Elle sert également à modifier la composition du tampon d'un échantillon. La dialyse est une technique passive qui nécessite de grands volumes de tampon.
Échange de tampon et dessalement
Le dessalement est une méthode simple permettant d'éliminer les sels et autres contaminants de faible poids moléculaire d'un échantillon. Il est également utilisé pour l'échange de tampon avant ou après différentes étapes chromatographiques et pour l'élimination rapide des réactifs afin de mettre fin à une réaction.
Précipitation fractionnée
La précipitation fractionnée est utilisée pour éliminer les impuretés grossières de petits volumes d'échantillon. Les techniques de précipitation séparent les fractions selon le principe de la solubilité différentielle. Comme les espèces protéiques diffèrent par leur degré d'hydrophobicité, une augmentation des concentrations en sel peut renforcer les interactions hydrophobes entre les protéines et provoquer une précipitation.
Extraction
La préparation d'échantillons par extraction consiste à isoler les analytes cibles d'un échantillon complexe ou d'un volume d'échantillon beaucoup plus important. Ce processus élimine les composants de l'échantillon susceptibles d'interférer et de bloquer les colonnes HPLC et GC. Il augmente également la concentration de l'analyte d'un facteur de 100 à 5 000, améliorant ainsi considérablement la sensibilité de détection. Dans le cadre d'une préparation d'échantillon sélective et spécifique, l'extraction contribue à garantir une analyse chromatographique plus fiable. Les types d'extraction sont l'extraction liquide-liquide, l'extraction en phase solide (SPE) et la micro-extraction en phase solide (SPME).
Chromatographie d'affinité
La chromatographie d'affinité sépare les protéines sur la base d'interactions réversibles entre une protéine et un ligand spécifique qui a été couplé à une matrice chromatographique. Cette technique est hautement sélective et permet une purification des protéines à grande capacité. La chromatographie d'affinité peut être utilisée dès lors qu'un ligand approprié est disponible pour la protéine d'intérêt.
La purification par chromatographie d'affinité comprend des étapes de capture et d'élution. Lors de la phase de capture, la protéine cible est liée de manière spécifique et réversible à un ligand complémentaire immobilisé sur une matrice chromatographique. L'objectif est d'isoler, de concentrer et de stabiliser le produit cible, tout en préservant son activité et son efficacité. Après lavage de la matrice pour éliminer les substances non liées, la protéine cible liée est récupérée en modifiant les conditions pour favoriser l'élution. L'élution est réalisée de manière spécifique, à l'aide d'un ligand compétitif, ou de manière non spécifique, en modifiant le pH, la force ionique ou la polarité. L'élution permet de recueillir la protéine cible sous une forme purifiée et concentrée.
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