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Merck

A2576

Agarose

Ultra-low Gelling Temperature, molecular biology grade

Synonyme(s) :

3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan

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A propos de cet article

Numéro CAS:
9012-36-6
UNSPSC Code:
41105317
PubChem Substance ID:
24890670
EC Number:
232-731-8
NACRES:
NA.21
MDL number:
MFCD00081294

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SMILES string

O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O

InChI

1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1

InChI key

MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

grade

Molecular Biology

type

Type IX-A

form

powder

technique(s)

electrophoresis: suitable

impurities

≤7% water

ash

≤0.4%

EEO

≤0.12

mp

≤62 °C

transition temp

gel point ≤20 °C (1.5% gel)

gel strength

≥300 g/cm2 (1.5% gel)

anion traces

sulfate (SO42-): ≤0.14%

Quality Level

200

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General description

Agarose is a polymer extracted from agar or agar-bearing marine algae. This purified linear galactan hydrocolloid comprises alternating co-polymers D-galactose and 3,6-anhydro-L-galactose units connected by α-(1→3) and β-(1→4) glycosidic bonds. Agarose is highly biocompatible and possesses variable mechanical and diffusion properties. Agarose can be used as a gelling agent, to separate nucleic acids electrophoretically.

Application

Agarose has been used:
  • in thaumatin and elastase protein crystallization
  • in microcasting using a polydimethylsiloxane (PDMS) mold with micro-channel
  • in agarose micro-confinement array

Agarose is super low melting point and recommended for use in capillary electrophoresis, tissues & cell culture, and viral plaque assay.
Yields unusually strong gels for an ultra-low gelling agarose. Ideal for electrophoresis of heat-labile samples and for growth of hybridomas or other cell lines.

Analysis Note

Nos agaroses ont les propriétés suivantes :
Teneur en sulfates : sert d'indicateur de pureté, le sulfate étant le principal groupement ionique présent.
Force du gel : équivaut à la force qu'il faut appliquer sur le gel pour le rompre.
Point de gélification : correspond à la température à laquelle une solution aqueuse d'agarose forme un gel en refroidissant. Les solutions d'agarose présentent une hystérésis lorsqu'elles passent de la forme liquide à la forme gélifiée, ce qui signifie que leur point de gélification n'est pas égal à leur température de fusion.
Électro-endosmose (EEO) : définit un mouvement de liquide à travers le gel. Les groupements anioniques d'un gel d'agarose sont fixés à la matrice et ne peuvent pas bouger, mais les contre-ions positifs dissociables peuvent migrer dans la matrice en direction de la cathode, créant ainsi une EEO. Comme le déplacement électrophorétique des biopolymères se fait généralement vers l'anode, l'EEO peut perturber les séparations en raison d'une convection interne.

Other Notes

Discover LiChropur reagents ideal for HPLC or LC-MS analysis

Classe de stockage

11 - Combustible Solids

wgk

WGK 1

flash_point_f

Not applicable

flash_point_c

Not applicable

ppe

Eyeshields, Gloves, type N95 (US)

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Certificats d'analyse (COA)

Lot/Batch Number
0000534166
0000534166
0000491067
0000491050
0000491050

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Agarose gel electrophoresis for the separation of DNA fragments
Lee PY, et al.
Journal of Visualized Experiments, 4(62) (2012)
Jan T Burri et al.
The New phytologist, 220(1), 187-195 (2018-06-16)
Physical forces are involved in the regulation of plant development and morphogenesis by translating mechanical stress into the modification of physiological processes, which, in turn, can affect cellular growth. Pollen tubes respond rapidly to external stimuli and provide an ideal
Jiaqing Yu et al.
Advanced healthcare materials, 5(23), 2983-2992 (2016-11-03)
Bacterial cellulose (BC) is a biocompatible material with high purity and robust mechanical strength used to fabricate desirable scaffolds for 3D cell culture and wound healing. However, the chemical resistance of BC and its insolubility in the majority of solutions
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Sugiyama S, et al.
Japanese Journal of Applied Physics, 48(7R), 075502-075502 (2009)
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Tanaka N, et al.
Royal Society of Chemistry Advances, 6(60), 54754-54762 (2016)
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