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Merck

A2790

Agarose

Wide range, Molecular Biology

Synonyme(s) :

3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan

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A propos de cet article

Numéro CAS:
9012-36-6
UNSPSC Code:
41105317
PubChem Substance ID:
24890692
EC Number:
232-731-8
NACRES:
NA.25
MDL number:
MFCD00081294

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biological source

algae (marine)

Quality Level

200

grade

Molecular Biology

form

powder

technique(s)

electrophoresis: suitable

EEO

≤0.15

mp

≤65 °C

transition temp

gel point ≤35 °C

anion traces

sulfate (SO42-): ≤0.15%

foreign activity

DNase, RNase, none detected

SMILES string

O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O

InChI

1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1

InChI key

MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

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Application

Wide range agarose is capable of separating DNA fragments from 50-1,000 bp on a single 3% agarose gel.

Analysis Note

Nos agaroses ont les propriétés suivantes :
Teneur en sulfates : sert d'indicateur de pureté, le sulfate étant le principal groupement ionique présent.
Force du gel : équivaut à la force qu'il faut appliquer sur le gel pour le rompre.
Point de gélification : correspond à la température à laquelle une solution aqueuse d'agarose forme un gel en refroidissant. Les solutions d'agarose présentent une hystérésis lorsqu'elles passent de la forme liquide à la forme gélifiée, ce qui signifie que leur point de gélification n'est pas égal à leur température de fusion.
Électro-endosmose (EEO) : définit un mouvement de liquide à travers le gel. Les groupements anioniques d'un gel d'agarose sont fixés à la matrice et ne peuvent pas bouger, mais les contre-ions positifs dissociables peuvent migrer dans la matrice en direction de la cathode, créant ainsi une EEO. Comme le déplacement électrophorétique des biopolymères se fait généralement vers l'anode, l'EEO peut perturber les séparations en raison d'une convection interne.

Classe de stockage

11 - Combustible Solids

wgk

WGK 3

flash_point_f

Not applicable

flash_point_c

Not applicable

ppe

Eyeshields, Gloves, type N95 (US)

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Certificats d'analyse (COA)

Lot/Batch Number
0000486790
0000486790
0000487478
0000487478
0000486788

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Neocortical expansion, thought to underlie the cognitive traits unique to humans, is accompanied by cortical folding. This folding starts around gestational week (GW) 20, but what causes it remains largely unknown. Extracellular matrix (ECM) has been previously implicated in neocortical
Michael J Lafferty et al.
The Journal of biological chemistry, 288(40), 28524-28534 (2013-08-21)
Elevated triglycerides are associated with an increased risk of cardiovascular disease, and lipoprotein lipase (LPL) is the rate-limiting enzyme for the hydrolysis of triglycerides from circulating lipoproteins. The N-terminal domain of angiopoietin-like protein 4 (ANGPTL4) inhibits LPL activity. ANGPTL4 was
Sujith V W Weerasinghe et al.
Journal of medicinal chemistry, 51(18), 5542-5551 (2008-08-30)
Histone deacetylase 1 (HDAC1) has been linked to cell growth and cell cycle regulation, which makes it a widely recognized target for anticancer drugs. Whereas variations of the metal-binding and capping groups of HDAC inhibitors have been studied extensively, the
Julia Dahlmann et al.
Biomaterials, 34(10), 2463-2471 (2013-01-22)
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Benjamin Pluvinage et al.
The Journal of biological chemistry, 288(39), 28078-28088 (2013-08-08)
The bacteria that metabolize agarose use multiple enzymes of complementary specificities to hydrolyze the glycosidic linkages in agarose, a linear polymer comprising the repeating disaccharide subunit of neoagarobiose (3,6-anhydro-l-galactose-α-(1,3)-d-galactose) that are β-(1,4)-linked. Here we present the crystal structure of a
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