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Merck

S9430

Colorant SYBR® Green I pour acides nucléiques sur gel

greener alternative

10,000 × in DMSO

Synonyme(s) :

DNA stain, SYBR® green gel dye, safer gel stain

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A propos de cet article

Numéro CAS:
UNSPSC Code:
12171500
NACRES:
NA.52
MDL number:
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form

solution

usage

 mL sufficient for 100 mini-gels

greener alternative product characteristics

Designing Safer Chemicals
Learn more about the Principles of Green Chemistry.

sustainability

Greener Alternative Product

concentration

10,000 × in DMSO

technique(s)

PCR: suitable

greener alternative category

storage temp.

−20°C

Quality Level

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General description

Le SYBR® Green I est un colorant cyanine asymétrique qui permet de détecter les acides nucléiques. Il se compose d'un système de cycles benzoxazolium ou benzothiazolium N-alkylé, lié par un pont monométhinique à un système de cycles pyridinium ou quinoléinium. Le colorant SYBR® Green I se lie au petit sillon de l'ADN double brin et est excité à une longueur d'onde de 480 nm. Il présente un pic d'émission de fluorescence à 520 nm.

Application

Le colorant SYBR® Green I pour acides nucléiques sur gel a été utilisé dans les situations suivantes :
  • quantification d'ADNdb.
  • coloration de l'ADN lors de PCR.
  • test de la comète.
  • évaluation de l'intégrité membranaire des spermatozoïdes.
  • contrôle visuel de l'ADN amplifié par LAMP (amplification isotherme en boucle).
  • cytométrie en flux (en tant que colorant fluorescent).
  • qRT-PCR (PCR quantitative après transcription inverse en temps réel) pour la coloration de l'ADNc rétrotranscrit.

Features and Benefits

  • Colorant ultrasensible pour la coloration de l'ADN double brin après électrophorèse sur gel d'agarose ou de polyacrylamide
  • Permet également de détecter l'ADN monocaténaire et l'ARN sur des gels de polyacrylamide/urée et d'agarose/formaldéhyde dénaturants, sans étape de prélavage
  • Moins mutagène que le bromure d'éthidium dans les tests d'Ames
  • 50 à 100 fois plus sensible que le bromure d'éthidium pour la détection des oligonucléotides
  • Utile dans de nombreuses applications où les quantités d'ADN sont limitées
  • N'inhibe pas l'activité de nombreuses endonucléases de restriction courantes, dont Hind III et EcoR I, une fois fixé sur l'ADN
  • S'élimine sans digestion sur gel ni ligature
  • Plus respectueux de l'environnement que le bromure d'éthidium pour la coloration

Preparation Note

Stocker le produit à -20 °C. La solution de coloration diluée peut être conservée à l′abri de la lumière, soit à 2-8 °C pendant plusieurs semaines, soit à température ambiante pendant 3 à 4 jours.

Legal Information

SYBR is a registered trademark of Thermo Fisher Scientific or its subsidiaries

Classe de stockage

10 - Combustible liquids

wgk

WGK 3

flash_point_f

201.2 °F - closed cup

flash_point_c

94 °C - closed cup

ppe

Eyeshields, Gloves, multi-purpose combination respirator cartridge (US)


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  4. What is the Department of Transportation shipping information for this product?

    Transportation information can be found in Section 14 of the product's (M)SDS.To access the shipping information for this material, use the link on the product detail page for the product. 

  5. Will Product S9430, SYBR® Green I nucleic acid gel stain, stain DNA that contains deaza-G modified nucleotides in place of guanisine?  

    Product S9430, SYBR® Green I nucleic acid gel stain, will poorly stain DNA containing deaza-G modified nucleotides in place of guanisine.  A way around this issue would be to use a mixture of deaza-G modified nucleotides with guanisine.  This will allow for better staining. 

  6. My question is not addressed here, how can I contact Technical Service for assistance?

    Ask a Scientist here.

Loop mediated isothermal amplification of 5.8S rDNA for specific
detection of Tritrichomonas foetus
Jorge Oyhenart
Veterinary Parasitology, 193 (2013)
I Ortiz et al.
Animal reproduction science, 187, 74-78 (2017-10-19)
The aim of this study was to compare sperm DNA fragmentation of frozen-thawed epididymal sperm of dogs using the SCSA (Sperm Chromatin Structure Assay) and SCDt (Sperm Chromatin Dispersion test). For this purpose, epididymis from neutered dogs were minced and
Shear-resistant hydrogels to control permeability of porous tubular scaffolds in vascular tissue engineering
Tresoldi C, et al.
Materials Science and Engineering, C, 105, 110035-110035 (2019)
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