biological source
algae (red)
Quality Level
grade
Molecular Biology
product line
BioReagent
form
powder
EEO
≤0.10
mp
≤65 °C
transition temp
congealing temperature 26-30 °C
gel strength
≥200 g/cm2 (1% gel)
anion traces
sulfate (SO42-): ≤0.10%
suitability
suitable for electrophoresis, suitable for molecular biology
foreign activity
DNase, RNase, NICKase, none detected
SMILES string
O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O
InChI key
MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N
General description
アガロースは紅藻の細胞壁に天然の状態で見出される寒天成分です。親水性であり、高いゲル化性を有します。アガロースは、多孔性ゲルを形成してDNA、RNAまたはタンパク質をサイズ別に分析する目的で、ゲル電気泳動で最も一般的に用いられています。システムに電圧を印加すると、荷電した核酸はアガロースゲルを通過して移動し、サイズ別に分離されます。アガロースは安定性とゲル化特性を有するため、用途が広く、いくつか例を挙げると、プラークアッセイやコメットアッセイなど、また足場剤としても、他の多くの用途で研究に使用することができます。
Application
低ゲル化アガロースは以下の用途で研究に用いられています:
- ゲル電気泳動のため。BMSCを用いた組織工学用ゲル-ゲル足場材料からのDNA抽出には低い融点が理想的です。
- 免疫組織学試験用に5%アガロースに組織を包埋するため。
- 軟部組織におけるコラーゲン-マトリックス相互作用を研究する目的でコラーゲン-アガロース共ゲルを調製するため。
- 単細胞ゲル電気泳動(コメットアッセイ)
- アガロースストリップ上に固定したゼブラフィッシュ幼生のin vivo三次元画像を得るため。
Features and Benefits
- ゲル電気泳動に適したバイオ試薬
- バンド分離範囲:200 bp~25 kB - 低いゲル化温度は細胞培養およびウイルスプラークアッセイに理想的
- 低融点(LMP)ゲルは、次のようないくつかのDNA回収法に適合:フェノール/クロロホルム抽出、回収カラム、電気溶出、β-アガーラーゼ法、および凍結/スクイーズ法
- 分子生物学試験用に検査された品質(DNaseおよびRNaseを含まない)保証付き
Analysis Note
以下に、当社のアガロースに関係する特性を示します。
硫酸を含みます-硫酸は重要なイオン基であることから、純度の指標として使用します。
ゲル強度-ゲルを砕くために必要とされるゲルに印加する力
ゲル点-水性アガロース溶液が冷却されてゲルを形成するときの温度。 アガロース溶液は、液体からゲルへの移行でヒステリシスを示しますーすなわち、ゲル点は融解温度とは異なります。
電気浸透(EEO)-液体がゲルを通過して移動すること。アガロースゲル中のアニオン基はマトリックスに付着しており移動できませんが、解離可能な対陽イオンはマトリックス中の陰極に移動でき、EEOを引き起こします。 生体ポリマーの電気泳動移動は通常陽極に向かいますが、EEOは内部滞留により分離を妨げることができます。
硫酸を含みます-硫酸は重要なイオン基であることから、純度の指標として使用します。
ゲル強度-ゲルを砕くために必要とされるゲルに印加する力
ゲル点-水性アガロース溶液が冷却されてゲルを形成するときの温度。 アガロース溶液は、液体からゲルへの移行でヒステリシスを示しますーすなわち、ゲル点は融解温度とは異なります。
電気浸透(EEO)-液体がゲルを通過して移動すること。アガロースゲル中のアニオン基はマトリックスに付着しており移動できませんが、解離可能な対陽イオンはマトリックス中の陰極に移動でき、EEOを引き起こします。 生体ポリマーの電気泳動移動は通常陽極に向かいますが、EEOは内部滞留により分離を妨げることができます。
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保管分類
11 - Combustible Solids
wgk
WGK 3
flash_point_f
Not applicable
flash_point_c
Not applicable
ppe
Eyeshields, Gloves, type N95 (US)
Mechanical and structural contribution of non-fibrillar matrix in uniaxial tension: a collagen-agarose co-gel model
Lake SP and Barocas VH
Annals of Biomedical Engineering, 39(7), 1891-1903 (2011)
Wioletta Skronska-Wasek et al.
American journal of respiratory and critical care medicine, 196(2), 172-185 (2017-03-01)
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD), in particular emphysema, is characterized by loss of parenchymal alveolar tissue and impaired tissue repair. Wingless and INT-1 (WNT)/β-catenin signaling is reduced in COPD; however, the mechanisms thereof, specifically the role of the frizzled (FZD)
Spencer P Lake et al.
Journal of biomedical materials research. Part A, 99(4), 507-515 (2011-09-14)
The mechanical properties of soft tissues depend on the collagen fiber network and the surrounding non-fibrillar matrix. The mechanical role of non-fibrillar material remains poorly understood. Our recent study (Lake and Barocas, Ann Biomed Eng 2011) introduced collagen-agarose co-gels as