F3174
Fpgタンパク質 大腸菌由来
≥90% (SDS-PAGE), buffered aqueous glycerol solution, >20,000 units/mg protein, suitable for genomic analysis
別名:
Fapy DNAグリコシラーゼ, MutM, ホルムアミドピリミジンDNAグリコシラーゼ
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この商品について
CAS番号:
UNSPSC Code:
12352202
NACRES:
NA.32
MDL number:
Form:
buffered aqueous glycerol solution
Assay:
≥90% (SDS-PAGE)
Biological source:
Escherichia coli
Recombinant:
expressed in E. coli
Mol wt:
30.2 kDa (269 amino acids, predicted from the nucleotide sequence)
biological source
Escherichia coli
recombinant
expressed in E. coli
assay
≥90% (SDS-PAGE)
form
buffered aqueous glycerol solution
specific activity
>20,000 units/mg protein
mol wt
30.2 kDa (269 amino acids, predicted from the nucleotide sequence)
composition
protein, 0.1- 0.3 mg/mL Bradford
storage condition
(Tightly closed)
technique(s)
nucleic acid detection: suitable
UniProt accession no.
application(s)
genomic analysis
shipped in
wet ice
storage temp.
−20°C
Quality Level
Gene Information
Escherichia coli CFT073 ... mutM(1038243)
Escherichia coli K12 ... mutM(946765)
General description
Formamidopyrimidine-DNA glycosylase (Fpg) is a DNA repair enzyme found in Escherichia coli, which contains one zinc atom. Proximal to its C-terminal, it contains a zinc-finger motif of CC/CC type.
Fpg contains two domains separated by a flexible hinge.
Research area: Cell signaling
Research area: Cell signaling
Application
Fpg Protein from Escherichia coli has been used for the assessment of DNA oxidative damage using comet assay.
Biochem/physiol Actions
Fpgタンパク質は、DNAの塩基除去修復(BER)経路における重要な酵素であり、ホルムアミドピリミジン(Fapy)や8-オキソグアニン(8-oxo-G)など広範囲にわたる修飾プリン塩基の除去反応を触媒します。 Fpgは、変異した塩基を除去するDNAグリコシラ-ゼ活性と、DNAの5′-および3′-のリン酸化末端を残してリボ-スを遊離するAPリア-ゼ活性の両方を有しています。in vitroにおいて、主としてFapyA、FapyGおよび8-oxo-GによるDNAの酸化的損傷を検出・定量するために、Fpg活性に基づいた複数の分析法が開発されています。fpg遺伝子はBoiteuxらによってクロ-ニングされました。Fpgタンパク質はC末端にzincフィンガ-モチ-フを有しています(1分子あたり亜鉛1原子)。この領域はDNAへの結合とAPリア-ゼ活性に関与しています。 さらに、N末端のプロリンは酵素作用に必須なシッフ塩基中間体を生じる求核剤として作用することが確認されています。
Fpg is a key enzyme in the DNA base excision repair pathway (BER). It catalyses the excision of a broad spectrum of modified purines. Fpg has both DNA glycosylase activity that removes the mutated base and AP-lyase activity that releases ribose leaving both 5′- and 3′-phosphorylated ends in the DNA. The zinc finger motif at its C-terminus is responsible for the DNA binding and AP-lyase activity. In addition, its N-terminal proline acts as a nucleophile to produce a Schiff base intermediate that is essential for enzyme action.
Fpg specifically acts on 3′- and 5′-phosphodiester bonds.
Physical form
50%グリセロ-ル溶液 (50mM HEPESカリウム, pH 7.5, 1mM DTT, 1mM EDTA, 200mM NaCl含有)。
Other Notes
1ユニットは、25°Cで10分間に0.5 pmolの二本鎖DNAオリゴマー基質(8-オキソグアニン変異)を50%切断する量です。
保管分類
10 - Combustible liquids
wgk
WGK 2
flash_point_f
Not applicable
flash_point_c
Not applicable
ppe
Eyeshields, Gloves, multi-purpose combination respirator cartridge (US)
適用法令
試験研究用途を考慮した関連法令を主に挙げております。化学物質以外については、一部の情報のみ提供しています。 製品を安全かつ合法的に使用することは、使用者の義務です。最新情報により修正される場合があります。WEBの反映には時間を要することがあるため、適宜SDSをご参照ください。
F3174-10UG: + F3174-BULK: + F3174-10UG-PW: + F3174-VAR:
jan
Kim Jantzen et al.
Mutagenesis, 27(6), 693-701 (2012-08-08)
Studies in mono-culture of cells have shown that diesel exhaust particles (DEPs) increase the production of reactive oxygen species (ROS) and oxidative stress-related damage to DNA. However, the level of particle-generated genotoxicity may depend on interplay between different cell types
Lotte Frigaard Mandsberg et al.
FEMS microbiology letters, 324(1), 28-37 (2011-11-19)
Prevention and correction of oxidative DNA lesions in Pseudomonas aeruginosa is ensured by the DNA oxidative repair system (GO). Single inactivation of mutT, mutY and mutM involved in GO led to elevated mutation rates (MRs) that correlated to increased development
Crystal structure of a repair enzyme of oxidatively damaged DNA, MutM (Fpg), from an extreme thermophile, Thermus thermophilus HB8
Sugahara M, et al.
The Embo Journal, 19(15), 3857-3869 (2000)
J Tchou et al.
The Journal of biological chemistry, 268(35), 26738-26744 (1993-12-15)
Fpg protein of Escherichia coli cleaves duplex DNA containing the oxidatively damaged base 8-oxo-7,8-dihydroguanine (Tchou, J., Kasai, H., Shibutani, S., Chung, M.-H., Laval, J., Grollman, A. P., and Nishimura, S. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 4690-4694). This DNA
Alwin B Mbene et al.
Journal of photochemistry and photobiology. B, Biology, 94(2), 131-137 (2008-12-23)
Phototherapy or biomodulation is a remarkable therapy that has become more popular and widely used in the treatment of a variety of medical conditions, such as slow to heal wounds, pain, soft tissue injuries and skin trauma. It has been
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