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Merck

WGA4

Kit d′amplification de génome complet de cellule unique GenomePlex®

Amplify genome of a single cell

Synonyme(s) :

Single cell whole genome amplification, Whole genome amplification

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A propos de cet article

UNSPSC Code:
12352200
EC Number:
254-457-8
NACRES:
NA.55
Service technique
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dilution

(WGA)

input

purified DNA

shipped in

wet ice

technique(s)

whole genome amplification: suitable

Quality Level

storage temp.

−20°C

General description

Le kit d'amplification du génome entier de cellules isolées GenomePlex® utilise une technologie exclusive basée sur la fragmentation aléatoire de l'ADN génomique et la conversion des petits fragments obtenus en molécules de banque amplifiables par PCR flanquées de sites d'amorçage universels. L'amplification du génome entier (WGA pour "Whole Genome Amplification") est obtenue par amplification PCR des molécules de la banque avec des amorces oligonucléotidiques universelles. Ce kit est conçu pour amplifier le génome d'une cellule unique. Son procédé simple et rapide permet d'amplifier l'ADN génomique plusieurs millions de fois, donnant plusieurs microgrammes de produit à partir d'une seule cellule. Outre leur rendement insuffisant, les méthodes classiques d'amplification du génome entier de cellules isolées introduisent d'importants biais de représentation. Ce kit contient tous les réactifs nécessaires à la lyse cellulaire suivie de l'amplification du génome entier. Les cellules peuvent être isolées par cytofluorométrie en flux (FACS pour "Fluorescence-Activated Cell Sorting"), microdissection par capture laser (LCM pour "Laser Capture Microdissection"), dilution ou toute autre technique appropriée.

Application

Le kit d'amplification du génome entier de cellules isolées GenomePlex® a été utilisé :

  • pour amplifier de l'ADN isolé
  • dans l'amplification du génome entier (WGA)
  • pour amplifier des ADN issus de microdissection
  • pour amplifier l'ADN génomique de cellules tumorales circulantes à partir de cellules du cancer de la prostate métastatique résistant à la castration
  • pour détecter la variation du nombre de copies par une technique de séquençage du génome entier de cellules isolées à faible taux de couverture
  • en électrophorèse sur gel
  • en qPCR
  • en hybridation génomique comparative sur microréseau
  • pour l'analyse des courtes répétitions en tandem (STR)
  • pour l'analyse des polymorphismes mononucléotidiques (SNP)

Features and Benefits

  • Amplification de l'ADN de haute précision et à haut rendement en 4 heures seulement
  • Amplification de l'ADN depuis n'importe quelle source : cellules cancéreuses, cellules épithéliales, lymphocytes, fibroblastes de liquide amniotique, cellules fixées sur du polycarbonate ou cellules végétales
  • Représentation complète de la totalité du génome avec un très faible biais allélique
  • ADN polymérase "WGA" adaptée aux applications en aval telles que l'électrophorèse sur gel, la qPCR, l'hybridation génomique comparative (CGH pour "Comparative Genomic Hybridization") sur microréseau, l'analyse des courtes répétitions en tandem (STR pour "Short Tandem Repeat"), l'analyse des polymorphismes mononucléotidiques (SNP pour "Single Nucleotide Polymorphism"), les tests TaqMan® et l'analyse des microsatellites

Other Notes

Les séquences des amorces universelles fournies dans ce kit sont brevetées.

Legal Information

L'utilisation de ce produit est protégée par un ou plusieurs des brevets américains suivants et les revendications des brevets correspondants en dehors des États-Unis : 5 789 224, 5 618 711, 6 127 155 et les revendications en dehors des États-Unis correspondant au brevet américain expiré n° 5 079 352. L'achat de ce produit inclut une immunité limitée et non transférable contre les poursuites dans le cadre des revendications des brevets susmentionnés concernant l'utilisation de cette seule quantité de produit pour les propres recherches internes de l'acheteur. Aucun droit en vertu d′une autre revendication de brevet, aucun droit d′appliquer une méthode brevetée et aucun droit d′assurer des services commerciaux de quelque nature que ce soit, notamment, mais sans caractère limitatif, la communication des résultats des activités de l′acheteur contre rémunération ou une autre considération commerciale, n′est transmis expressément, par implication, ou par préclusion. Ce produit est réservé aux activités de recherche. Les utilisations diagnostiques protégées par les brevets de Roche nécessitent l′octroi d′une autre licence par Roche. De plus amples informations sur l′achat de licences peuvent être obtenues auprès du directeur de l'attribution des licences à l′adresse Applied Biosystems, Director of Licensing, 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, Californie, 94404, USA.
GenomePlex is a registered trademark of Takara Bio USA, Inc.
TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc.

Composants de kit également disponibles séparément

Réf. du produit
Description
FDS

  • L104310x Single Cell Lysis & Fragmentation BufferFDS

  • P4850Proteinase K from Tritirachium album, buffered aqueous glycerol solution, Molecular Biology, ≥800 units/mLFDS

  • W4502Water, Nuclease-Free Water, for Molecular BiologyFDS

pictograms

Health hazard

signalword

Danger

hcodes

Hazard Classifications

Resp. Sens. 1

Classe de stockage

10 - Combustible liquids

flash_point_f

Not applicable

flash_point_c

Not applicable

wgk

WGK 3


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    The lot specific COA document can be found by entering the lot number above under the "Documents" section.

  3. Can the amplified Omniplex products resulting from the use of Product WGA4, GenomePlex® Single Cell Whole Genome Amplification Kit, be used for TA cloning?

    Yes.  Please ensure that a final extension of 7-30 minutes at 72°C is included after amplification if performing subsequent TA cloning reactions.

  4. Can Product WGA4, GenomePlex® Single Cell Whole Genome Amplification Kit, be used with purified DNA?

    Yes. The kit is designed to amplify the small amount of DNA that is present in a single cell (3-5 pg). It will also work with small amounts of purified DNA; we recommend less than 100 pg.

  5. What kinds of cells can be used as starting materials with Product WGA4, GenomePlex® Single Cell Whole Genome Amplification Kit?

    The cell lysis method involves treatment with proteinase K and heat. Most cells will be lysed under these conditions.

  6. How do I find price and availability?

    There are several ways to find pricing and availability for our products. Once you log onto our website, you will find the price and availability displayed on the product detail page. You can contact any of our Customer Sales and Service offices to receive a quote.  USA customers:  1-800-325-3010 or view local office numbers.

  7. What is the Department of Transportation shipping information for this product?

    Transportation information can be found in Section 14 of the product's (M)SDS.To access the shipping information for this material, use the link on the product detail page for the product. 

  8. My question is not addressed here, how can I contact Technical Service for assistance?

    Ask a Scientist here.

Timour Baslan et al.
eLife, 9 (2020-05-14)
Copy number alterations (CNAs) play an important role in molding the genomes of breast cancers and have been shown to be clinically useful for prognostic and therapeutic purposes. However, our knowledge of intra-tumoral genetic heterogeneity of this important class of
Nicholas Navin et al.
Nature, 472(7341), 90-94 (2011-03-15)
Genomic analysis provides insights into the role of copy number variation in disease, but most methods are not designed to resolve mixed populations of cells. In tumours, where genetic heterogeneity is common, very important information may be lost that would
Nathan R Treff et al.
Fertility and sterility, 94(6), 2017-2021 (2010-03-02)
To develop and validate a whole genome amplification and single nucleotide polymorphism (SNP) microarray protocol for accurate single cell 24 chromosome aneuploidy screening. Prospective, randomized, and blinded study. Academic reproductive medicine center. Multiple euploid and aneuploid cell lines were obtained
Nathan R Treff et al.
Molecular human reproduction, 16(8), 583-589 (2010-05-21)
Many studies estimate that chromosomal mosaicism within the cleavage-stage human embryo is high. However, comparison of two unique methods of aneuploidy screening of blastomeres within the same embryo has not been conducted and may indicate whether mosaicism has been overestimated
Hitoshi Hiura et al.
Nucleic acids research, 38(15), 4929-4945 (2010-04-14)
The parent-of-origin specific expression of imprinted genes relies on DNA methylation of CpG-dinucleotides at differentially methylated regions (DMRs) during gametogenesis. To date, four paternally methylated DMRs have been identified in screens based on conventional approaches. These DMRs are linked to

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