Épigénétique

Modification des histones

La chromatine est le complexe constitué de l'ADN génomique et des protéines qui y sont associées dans le noyau. Les modifications de la structure de la chromatine et les interactions entre les protéines de la chromatine jouent un rôle direct dans la régulation épigénétique. La structure de la chromatine est assurée par les histones, une classe majeure de protéines de la chromatine. Les histones forment le nucléosome, un complexe composé de deux sous-unités de chacune des histones H2A, H2B, H3 et H4. À l’extérieur du complexe central, l’histone de liaison H1 occupe l’ADN inter-nucléosomique. Ce complexe nucléosomique maintient la structure compacte de la chromatine. Les modifications spécifiques des histones, telles que la méthylation, l’acétylation, la phosphorylation, l’ubiquitination et la citrullination, peuvent altérer la structure locale de la chromatine et réguler la transcription, la réparation, la recombinaison et la réplication. Les protéines non histones associées à la chromatine constituent un groupe hétérogène comprenant des milliers de types de protéines différents, notamment des facteurs de transcription, des polymérases, des récepteurs hormonaux et d’autres enzymes nucléaires.

Méthylation de l’ADN

La méthylation de l’ADN est un mécanisme épigénétique important qui régule le silençage génique, l’empreinte génétique, le développement embryonnaire et la stabilité chromosomique. La méthylation de l’ADN se produit au niveau de la position du 5e atome de carbone des résidus de cytosine, principalement au sein des dinucléotides CpG, pour former des 5-méthylcytosines (5-mC). La réaction est catalysée par les méthyltransférases d’ADN (DNMT). Les résidus de 5-méthylcytosine peuvent également être hydroxylés par les enzymes TET pour former de la 5-hydroxyméthylcytosine (5-hmC), dont les rôles diffèrent de ceux de la 5-mC. Nous proposons des outils performants qui vous permettent non seulement de détecter et de quantifier la 5-mC et la 5-hmC, mais aussi de distinguer avec précision ces deux modifications.

Kits d’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP)

La détection quantitative des modifications des histones est essentielle pour mieux comprendre la régulation épigénétique des processus cellulaires dans les tissus normaux ou cancéreux. La technique la plus couramment utilisée pour étudier comment les modifications des histones et d’autres protéines se liant à l’ADN, telles que les facteurs de transcription, influencent l’expression génique est appelée immunoprécipitation de la chromatine (ChIP), associée à la réaction en chaîne par polymérase qualitative (qPCR). La technique ChIP consiste à réticuler chimiquement des protéines à des séquences d’ADN, puis à procéder à l’immunoprécipitation des complexes réticulés à l’aide d’anticorps et de billes afin d’isoler l’histone modifiée ou d’autres protéines d’intérêt. Les modifications des histones les plus couramment étudiées et les mieux comprises sont l’acétylation, la phosphorylation, la méthylation et l’ubiquitination. Les modifications des histones régulent la transcription, la réparation, la recombinaison et la réplication de l’ADN, et peuvent modifier l’architecture locale de la chromatine. Découvrez notre large gamme de kits destinés à l’analyse des profils complexes de modifications des histones.

Contrôle transcriptionnel et post-transcriptionnel : régulation de l’ARN

Traditionnellement, la recherche sur l’expression génique s’est concentrée sur la régulation transcriptionnelle via les interactions des facteurs de transcription avec des sites de liaison spécifiques, les modifications des histones au sein de la chromatine et la dynamique coordonnée de la chromatine associée aux changements dans la transcription génique. La recherche actuelle sur l’expression génique cherche à comprendre la dynamique de la régulation de l’ARN, avec pour objectif ultime de combler le fossé entre le contrôle transcriptionnel et l’expression protéique. Les protéines de liaison à l’ARN (RBP) jouent un rôle clé dans la régulation post-transcriptionnelle de l’expression génique.

Régulation de l’ARN : kits d’immunoprécipitation des protéines de liaison à l’ARN (RIP)

La RIP peut être considérée comme l’équivalent, pour l’ARN, de l’application ChIP plus connue. La RIP permet d’identifier des molécules d’ARN spécifiques associées à des protéines de liaison nucléaires ou cytoplasmiques spécifiques. La RIP commence par l’immunoprécipitation de complexes endogènes de protéines de liaison à l’ARN et par la co-isolation des espèces d’ARN associées au complexe immunoprécipité. Une fois ces espèces d’ARN purifiées, elles peuvent être analysées et identifiées comme des ARNm ou des ARN non codants à l’aide de diverses techniques, notamment la RT-PCR quantitative, l’analyse par puces à ADN (RIP-Chip) et le séquençage à haut débit (RIP-Seq).