臭化エチジウム 溶液

生化学用

臭化エチジウム(EtBr)は、PAGEまたはアガロースゲル電気泳動で核酸の染色に最も一般的に使用されています。EtBrの蛍光は、二本鎖RNAに結合すると21倍に、二本鎖DNAに結合すると25倍に増加するため、低濃度(10 μg/mL)で染色する場合はバックグラウンドを脱色する必要がありません。臭化エチジウムは、核酸に対する蛍光分析で多数使用されています。一本鎖DNAと(強力ではないが)結合し、また三本鎖DNAと結合することが示されています。DNAに結合する能力があることから、EtBrはDNAポリメラーゼの阻害剤です。

臭化エチジウムは二本鎖のDNAとRNAとにインターカレーションし、フレームシフト型変異原物質として作用します。生存細胞、アポトーシス細胞、および壊死細胞を区別するため、アクリジンオレンジと併用することもできます。

電気泳動後のゲルの染色に用いる場合は、ストック溶液を水で0.5 μg/mlに希釈して、15~30分間ゲルを浸漬します。通常、脱色の必要はありませんが、バックグラウンドを下げる必要がある場合は水に15分間浸漬します。染色後、UVライトボックス(波長254 nm)上でDNAのバンドを検出します。ゲルおよび泳動用バッファーに臭化エチジウムを0.5 μg/mlとなるよう添加しておくと、泳動終了後すぐにバンド検出を行なうことができます。